随着新冠病毒在全球持续蔓延,大量突变毒株不断涌现,突变毒株免疫逃逸的发生及传播力感染力的增强给疫情防控带来更加严峻的挑战。突变毒株的快速精准检测将大力推动新冠突变流行高效预警监测及新冠精准防控。
目前病毒变异株检测主要依赖于核酸测序,不仅耗时长且成本高昂。CRISPR系统的单碱基识别特性使其成为突变检测新型利器。华南理工大学黄黎珍副教授课题组与杜红丽教授课题组在团队Cas12介导CORDS检测系统及突变大数据自动分析平台之上,联合广东省疾病预防控制中心、南方医科大学、中山大学等单位进一步开发新冠变异株检测方法RT-CORDS,可快速、准确检测N501Y、D614G以及Δ69/70的变异株(图1)。该检测方法操作简便,可快速实现多种突变同步精准检测(单碱基突变、小片段缺失等)。相关成果发表在检测领域国际权威期刊Biosensors and Bioelectronics(影响因子10.61)。
图一. RT-CORDS新冠变异株检测平台
RT-CORDS通过设计针对突变株和非突变株特异性Cas12a/crRNA-M及Cas12a/crRNA-M,采用荧光报告系统,40分钟可检测D614G突变株,N501Y及69/70 del变异株检测时间仅需10分钟;检测灵敏度达6 copies/μL(图二)。
图二. RT-CORDS荧光检测平台检测N501Y、D614G和69/70deletion变异株
为了进一步简便操作流程,课题组同时开发RT-CORDS试纸条突变检测系统,肉眼可视化直接读取检测变异株和非变异株。18例不同突变毒株的检测结果表明,试纸条突变检测结果与测序结果完全一致(准确度100%)(图三)。
图三. RT-CORDS试纸条平台检测SARS-CoV-2变异株
该项成果于2022年2月15日发表在检测领域国际权威期刊Biosensors and Bioelectronics(影响因子10.61),黄黎珍副教授为通讯作者,硕士研究生何昌生为第一作者,华南理工大学生物科学与工程学院为第一单位,广东省疾病预防控制中心为第二单位。
该项工作得到国家重点研发计划(2018YFC0910201)、国家自然科学基金(31871292)和广东省自然科学基金(2019A1515010619)等项目资助。
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https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0956566321008940?via%3Dihub
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