多肽的纯度是通过利用HPLC测定目标肽中肽键的紫外吸收进行测定,水和残留的盐类并不能通过UV检测器进行测定。其主要杂质包括:残缺序列肽(比目的肽少一个或更多氨基酸残基的短肽)、截序列(因防止残缺序列肽的产生封端产生的多肽)、不完全的脱保护肽(合成或者最终切割过程中产生的多肽)。
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