FAM-labeled (ab/em = 494/518nm) LL-37. LL-37 is an antimicrobial peptide with angiogenic activity. It corresponds to the C-terminal sequence (134-170) of the human cathelicidin antimicrobial protein hCAP18/LL-37. hCAP18/LL-37 is an effector of the innate
编号：125226
CAS号：2243219-81-8
单字母：5FAM-LCLLGDFFRKSKEKIGKEFKRIVQRIKDFLRNLVPRTES-OH
| 编号: | 125226 |
| 中文名称: | 5Fam-LC-LL-37 |
| 英文名: | 5Fam-LC-LL-37 |
| 英文同义词: | Fluorescein-5-carbonyl-LLGDFFRKSKEKIGKEFKRIVQRIKDFLRNLVPRTES |
| CAS号: | 2243219-81-8 |
| 单字母: | 5FAM-LCLLGDFFRKSKEKIGKEFKRIVQRIKDFLRNLVPRTES-OH |
| 三字母: | 5FAM N端标记5-FAM -Leu亮氨酸 -Cys半胱氨酸 -Leu亮氨酸 -Leu亮氨酸 -Gly甘氨酸 -Asp天冬氨酸 -Phe苯丙氨酸 -Phe苯丙氨酸 -Arg精氨酸 -Lys赖氨酸 -Ser丝氨酸 -Lys赖氨酸 -Glu谷氨酸 -Lys赖氨酸 -Ile异亮氨酸 -Gly甘氨酸 -Lys赖氨酸 -Glu谷氨酸 -Phe苯丙氨酸 -Lys赖氨酸 -Arg精氨酸 -Ile异亮氨酸 -Val缬氨酸 -Gln谷氨酰胺 -Arg精氨酸 -Ile异亮氨酸 -Lys赖氨酸 -Asp天冬氨酸 -Phe苯丙氨酸 -Leu亮氨酸 -Arg精氨酸 -Asn天冬酰胺 -Leu亮氨酸 -Val缬氨酸 -Pro脯氨酸 -Arg精氨酸 -Thr苏氨酸 -Glu谷氨酸 -Ser丝氨酸 -OHC端羧基 |
| 氨基酸个数: | 39 |
| 分子式: | C235H366O61N62S1 |
| 平均分子量: | 5067.86 |
| 精确分子量: | 5064.72 |
| 等电点(PI): | 11.7 |
| pH=7.0时的净电荷数: | 6.97 |
| 平均亲水性: | 0.56111111111111 |
| 疏水性值: | -0.53 |
| 消光系数: | - |
| 来源: | 人工化学合成，仅限科学研究使用，不得用于人体。 |
| 纯度: | 95%、98% |
| 盐体系: | 可选TFA、HAc、HCl或其它 |
| 生成周期: | 2-3周 |
| 储存条件: | 负80℃至负20℃ |
| 标签: | FAM、FITC修饰肽 抗菌肽(Antimicrobial Peptides AMPs) |
FAM-labeled (ab/em = 494/518nm) LL-37. LL-37 is an antimicrobial peptide with angiogenic activity. It corresponds to the C-terminal sequence (134-170) of the human cathelicidin antimicrobial protein hCAP18/LL-37. hCAP18/LL-37 is an effector of the innate immune system and is expressed in leukocytes and epithelial cells where it is upregulated in association with inflammation and injury. An overexpression of hCAP18/LL-37 in a series of breast carcinomas could be demonstrated. LL-37 has been suggested to stimulate epithelial cell proliferation partially through formyl peptide receptor-like 1 (FPRL1).
多肽荧光标记由于没有放射性，实验操作简单。因此，目前在生物学研究中多肽荧光标记应用非常广泛，多肽荧光标记方法与荧光试剂的结构有关系，对于有游离羧基的采用的方法与接多肽反应相同，也采用HBTU/HOBt/DIEA方法连接。 在N端标记FITC的多肽需经历环化作用来形成荧光素，通常会伴有最后一个氨基酸的去除，但当有一个间隔器如氨基己酸，或者是通过非酸性环境将目的多肽从树脂上切下来时，这种情况可避免在切割的过程中被TFA切割掉。
人们利用利用荧光标记的多肽来检测目标蛋白的活性，并将 其发展的高通量活性筛选方法应用于疾病治疗靶点蛋白的药物筛选和药物开发（例如，各种激 酶、磷酸酶、肽酶等）。
专肽生物能够提供技术成熟的各种荧光标记多肽。
下面是一些常见的多肽修饰荧光物质结构：
FITC标记
FITC(异硫氰酸荧光素)具有比较高的活性，我们公司可以通过两种方式将FITC标记于多肽 上：(1) 将FITC标记于赖氨酸（Lys）或被选择性地脱保护的鸟氨酸（ornithine）侧链氨基 上；(2) 将FITC标记于多肽N端氨基。
当在N端标记时，建议在最后一个氨基和由异硫氰酸酯与氨基反应产生的硫脲键之间引入 烷基间隔器（alkyl spacer），如氨基己酸（Ahx）。链接切割需要酸性环境，在N端标记FITC 的多肽需经历环化作用来形成荧光素，通常会伴有最后一个氨基酸的去除，但当有一个间隔器 如氨基己酸，或者是通过非酸性环境将目的肽从树脂上切下来时，这种情况可避免。空间位阻 被认为是在荧光染料前使用Ahx的主要原因，而不是为什么FITC不能直接偶联在多肽上的原因。
Ahx或b-Ala均可作为间隔器用于FITC标记的多肽上。
| 荧光修饰中文名称 | N端 | N端带有linker |
| 生物素标记多肽 | Biotin- | Biotin-Ahx- |
| 异硫氰酸荧光素 | FITC- | FITC-Ahx- |
| 5-羧基荧光素 | 5-FAM- | 5-FAM-Ahx- |
| 丹磺酰荧光素 | Dansyl- | Dansyl-Ahx- |
| 5-羧基四甲基罗丹明 | TMR- （TAMRA-） | TMR-Ahx- （TAMRA-Ahx-） |
| 多肽N端 | 多肽序列中间 | N端带有linker |
| 生物素标记多肽 | Biotin- | 多肽C端 |
| Lys(Biotin)- | -Lys(Biotin)-- | -Lys(Biotin) |
| Lys(FITC)- | -Lys(FITC)- | -Lys(FITC) |
| Lys(5-FAM)- | -Lys(5-FAM)- | -Lys(5-FAM) |
| Lys(Dansyl)- | -Lys(Dansyl)- | -Lys(Dansyl) |
| Lys(TMR)- | -Lys(TMR)- | -Lys(TMR) |
| Lys(Dnp)- | -Lys(Dnp)- | -Lys(Dnp) |
专肽常做的荧光物质的激发光波长和发射光波长。可供参考选择：
| 荧光基团 | Ex（nm） | Em（nm） | 荧光基团 | Ex（nm） | Em（nm） |
| 羟基香豆素 | 325 | 386 | R-phycoerythrin (PE) (489) | 565 | 578 |
| 丹磺酰氯 | 340 | 578 | Rhodamine Red-X | 560 | 580 |
| AMC | 345 | 445 | Tamara | 565 | 580 |
| 甲氧基香豆素 | 360 | 410 | Alexa fluor 555 | 556 | 573 |
| Alexa fluor 系列 | 345 | 442 | Alexa fluor 546 | 556 | 573 |
| 氨基香豆素 | 350 | 445 | Rox | 575 | 602 |
| Dabcyl | 453 | - | Alexa fluor 568 | 578 | 603 |
| Cy2 | 490 | 510 | Texas Red | 589 | 615 |
| FAM | 495 | 517 | Alexa fluor 594 | 590 | 617 |
| Alexa fluor 488 | 494 | 517 | Alexa fluor | 621 | 639 |
| FITC | 495 | 519 | Alexa fluor 633 | 650 | 668 |
| Alexa fluor 430 | 430 | 545 | Cy5 (625) | 650 | 670 |
| 5-FAM | 492 | 518 | Alexa fluor 660 | 663 | 690 |
| Alexa fluor 532 | 530 | 530 | Cy5.5 | 675 | 694 |
| HEX | 535 | 556 | TruRed | 490; 675 | 695 |
| 5-TAMRA | 542 | 568 | Alexa fluor 680 | 679 | 702 |
| Cy3 | 550 | 570 | Cy7 | 743 | 767 |
| TRITC | 547 | 572 | Cy3.5 | 581 | 596 |
AMPs是由相对较小的分子组成的异质基团，通常含有不到100个氨基酸。 它们最初是在20世纪60年代由Zeya和Spitznagel 在多形核白细胞溶酶体中描述的。 迄今为止，已在数据库（如数据库）中 确定和登记了2600多个AMP。 它们是由几乎所有的生物群产生的，包括细菌、真菌、植物和动物。 许多脊椎动物AMPs是由上皮表面分泌的，如 哺乳动物的气管、舌、肠粘膜或两栖动物的皮肤。 有些在中性粒细胞、单核 细胞和巨噬细胞中表达。 AMPs参与动物和植物的免疫防御系统。 构成表达或诱导它们在抵御微生物入侵者 的第一道防线中起着关键作用。
结构/分类 AMPs可以根据其氨基酸组成和结构进行分类。 可以区分两大类AMP。
第一类由线性分子组成，它们要么倾向于采用α螺旋结构，要么富含精氨酸、甘氨 酸、组氨酸、脯氨酸和色氨酸等某些氨 基酸。
第二类由含半胱氨酸的肽组成， 可分为单一或多个二硫结构。 在许多情 况下，抗菌活性需要存在二硫桥。 大多数AMPs是阳离子肽，但也有阴离子肽，如真皮素，一种富含天冬氨酸 的人肽和两栖动物的最大蛋白H5皮肤。 其他非阳离子AMPs包括神经肽前体分子的片段，如原啡肽A， 芳香二肽主要从二翅目幼虫中分离出来，或从节肢动物或茴香物种的氧结合 蛋白中提取的肽。
专肽生物可定制合成各类序列的抗菌肽，可标记FITC/FAM/TAMRA等常见荧光素。
Definition
Antimicrobial peptides (AMPs) are as widespread as bacterial inactivator molecules in the innate immune systems of insects, fungi, plants, and mammals. These peptides are also known as host defense peptides (HDPs) as they have other immuno-modulatory functions besides the direct antimicrobial actions and are even capable of killing cancerous cells 1,2.
Classification
Three broad categories of HDPs have been identified: 1) the linear peptides with helical structures, 2) the cysteine stabilized peptides with beta-sheet, and 3) a group of linear peptides rich in proline and arginine that primarily have been identified in non-mammalian species.
Structural characteristics
In mammals, cathelicidins and defensins are the two principal AMP families. Cathelicidins are peptides with a conserved proregion and a variable C-terminal antimicrobial domain. Defensins are the best-characterized AMPs, they have six invariant cysteines, forming three intramolecular cystine-disulfide bonds.
Mode of action
The mode of action of AMPs elucidated to date include inhibition of cell wall formation, formation of pores in the cell membrane resulting in the disruption of membrane potential with eventual lysis of the cell. These peptides also inhibit nuclease activity of both RNase and DNase.
Functions
They have a broad ability to kill microbes. AMPs form an important means of host defense in eukaryotes. Large AMPs (>100 amino acids), are often lytic, nutrient-binding proteins or specifically target microbial macromolecules. Small AMPs act by disrupting the structure of microbial cell membranes. It plays an active role in wound repair and regulation of the adaptive immune system. They have multiple roles as mediators of inflammation with impact on epithelial and inflammatory cells, influencing diverse processes such as cell proliferation, wound healing, cytokine release, chemotaxis and immune induction 3.
References
1. Gottlieb CT, Thomsen LE, Ingmer H, Mygind PH, Kristensen HH, Gram L(2008). Antimicrobial peptides effectively kill a broad spectrum of Listeria monocytogenes and Staphylococcus aureus strains independently of origin, sub-type, or virulence factor expression. BMC Microbiol., 8:205.
2. Yeaman MR and Yount NY (2003). Mechanisms of Antimicrobial Peptide Action and Resistance. Pharmocological Reviews, 55(1).
3. Hanna Galkowska H and Olszewski WL (2003). Antimicrobial peptides – their role in immunity and therapeutic potential. Centr Eur J Immunol., 28 (3):138–141.
