2020年6月22日，国际著名期刊Nature Ecology & Evolution（2018 IF=10.965）杂志在线发表了深圳华大生命科学研究院主导完成、华南理工大学参与的题为“The genome of Prasinoderma coloniale unveils the existence of a third phylum within green plants”的研究论文，该论文的第一作者李林洲为华南理工大学-华大“基因组科学”创新班学生，于2019年10月硕士毕业后，成为华大生命科学院研究院与丹麦 KU/DTU联合培养博士研究生。该研究报道了绿色植物中存在一直以来未被发现的新门类，揭示了绿色植物起源和演化的关键节点，并解释了早期绿色植物进化的分子机制。界-门-纲-目-科-属-种，是目前公认的生物学分类系统。绿色植物现分为两大分支：链型植物（包含轮藻门和所有的有胚植物）和绿藻门。本研究发现绿色植物的第三个门类，彻底改变绿色植物的分类；同时将现在植物界14个门类增修为15个门类。本研究主要由中国科学家主导完成，因此将此门类的中文名暂定为“华藻门”。

该研究报道了一种生活在深海(距海面百米以下)的单细胞浮游绿藻Prasinoderma coloniale CCMP 1413 (图1)。该研究首先获得了一个无任何gap的染色体级别基因组，结合基因组、转录组、核糖体RNA数据的多重系统发育分析，以及比较基因组学分析，确定了该物种属于绿色植物最早分化出来的一个新门类——华藻门Prasinodermaphyta，与已知的链型植物分支和绿藻门分支为姐妹关系(图1，图2)。

图1：绿色植物界新门类-定名为“华藻门”Prasinodermaphyta的系统发育关系。

图2：比较基因组学揭示Prasinoderma coloniale基因构成的特异性。

综上所述，该研究报道了绿色植物一个全新的门类，将绿色植物从2个门类增加为3个门类，并且证明了华藻门为最早分化的绿色植物分支。同时，该研究通过比较基因组学揭示了其代谢的进化和环境适应机制，对认识整个绿色生命系统起源具有重要的理论和实践意义。

参考消息：https://doi.org/10.1038/s41559-020-1221-7

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