4月14日,我院凌飞教授课题组联合华大基因李林课题组在美国微生物学会旗下的mSystems(IF=6.5)杂志上在线发表以华南理工大学为第一完成单位的题为Meta-analysis of 16S rRNA Microbial Data Identified Distinctive and Predictive Microbiota Dysbiosis in Colorectal Carcinoma Adjacent Tissue的结直肠肿瘤肠道微生物研究文章。凌飞老师指导的我院2017级华工-华大联合培养硕士生莫宗超和华大基因黄培德博士为本文的共同第一作者(论文链接:https://msystems.asm.org/content/5/2/e00138-20)。
结直肠肿瘤是当前恶性肿瘤当中被证明和肠道微生物有密切关系的癌种。目前已有大量研究利用宏基因组测序和扩增子测序深入表征结直肠肿瘤的粪便(Stools)和病灶组织(Onsite Tissue)微生物特性,但对结直肠肿瘤周边组织(Adjacent Tissue)微生物特征的研究尚有不足。
该研究首次基于大规模的公开扩增子数据集揭示了结直肠肿瘤周边组织的微生物紊乱现象。研究发现,当以正常结直肠组织作为对照的时候,结直肠肿瘤周边组织与病灶组织的微生物富集和耗竭模式有高度的重叠。进一步的网络互作分析表明,结直肠肿瘤周边组织与病灶组织的微生物相互作用网络高度相关,并且这种相关性在去除样本配对关系之后依旧成立。
除此之外,运用随机森林算法,该研究指出结直肠肿瘤周边组织的微生物标记物可以有效区分结直肠癌和正常对照(曲线下面积AUC=0.958),在性能上和基于结直肠癌病灶组织微生物标记物的分类器(曲线下面积AUC=0.960)没有显著差异(DeLong's 检验p= 0.402),提示通过对病灶周边组织进行取样,一样可以有效区分疾病组和对照组。
该研究为进一步研究肠道微生物在结直肠肿瘤发生发展过程中的生物学机制提供了重要线索,为进一步明确结直肠肿瘤病灶组织和周边组织的“微生物-宿主”相互作用奠定基础。这一发现亦或可推动未来基于肠道微生物的结直肠肿瘤检测研究和应用。
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