实验室开发了一种新的基于内共生学说的代谢网络空缺填补的方法(DEF),用于高精度的代谢网络空缺填补。通过系统生物学的方法和实验手段对网络进行精细的修正和评估,包括化合物胞内价态的计算,反应方程式的配平,反应可逆性的预测,空缺的查找及填补。该成果以“DEF: An automated dead-end filling approach based on quasi-endosymbiosis”为题发表在《Bioinformatics》(IF=5.766)。该论文第一作者为刘丽丽博士,第二、第三作者张子钧、盛涛涛均为我院本科生。
近期陈铭教授实验室围绕植物非编码RNA也在线发表了若干论文。
1. Chunhui Yuan, Xianwen Meng, Xue Li, Nicola Illing, Robert Ingle, Jingjing Wang, Ming Chen* (2016) PceRBase: A database of plant competing endogenous RNA. Nucleic Acids Research, DOI: 10.1093/nar/gkw916. (IF=9.202)
2. Xianwen Meng, Xue Li, Peijing Zhang, Jingjing Wang, Yincong Zhou, Ming Chen* (2016) Circular RNA: an emerging key player in RNA world. Briefings in Bioinformatics, DOI: 10.1093/bib/bbw045. (IF=8.399)
版权与免责声明:本网页的内容由收集互联网上公开发布的信息整理获得。目的在于传递信息及分享,并不意味着赞同其观点或证实其真实性,也不构成其他建议。仅提供交流平台,不为其版权负责。如涉及侵权,请联系我们及时修改或删除。邮箱:sales@allpeptide.com