近日,我校生科院钟伯坚课题组在绿藻系统发育基因组学研究方面取得进展。相关研究成果以“Chloroplast Phylogenomic Inference of Green Algae Relationships”在Nature旗下期刊Scientific Reports (IF: 5.578) 发表。生科院基地班11级本科生孙林华为该文章第一作者,钟伯坚教授为通讯作者。
文章链接:http://www.nature.com/articles/srep20528
绿藻的生命形式多样,生长环境广泛,不仅在整个生态系统中占据重要地位,而且具有相对复杂的进化历史,因此绿藻的系统进化研究一直是植物学关注的热点。钟伯坚课题组利用绿藻大规模的叶绿体基因组数据,结合系统发育基因组学的研究手段,探讨了绿藻各个纲之间的系统进化关系。同时对碱基异质性、位点进化速率和碱基替代模型适合度的相关性进行了分析,发现进化速率较快的位点,其碱基异质性较高,对模型的适合度较差。这为今后植物分子系统学的研究提供了有效的分析手段。
该项工作得到了国家自然科学基金、江苏省自然科学基金、江苏省优势学科建设项目、南京师范大学“百人计划”和本科优秀毕业设计(论文)培育计划等项目的支持。
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