1月14日，江元生院士遗体告别仪式在南京西天寺殡仪馆举行。
    中共中央总书记、国家主席、中央军委主席习近平委托中共中央办公厅打来电话对江元生院士的逝世表示深切哀悼，对其亲属表示亲切慰问。

    原中共中央总书记、原国家主席、原中央军委主席胡锦涛委托中国科学院对江元生院士的逝世表示深切哀悼，对其亲属表示亲切慰问，并代送花圈。

    中共中央政治局常委、国务院总理李克强，原中共中央政治局常委、原国务院总理温家宝，中共中央政治局常委、全国人大常委会委员长张德江，中共中央政治局常委、中央书记处书记、中央党校校长刘云山，中共中央政治局常委、国务院副总理张高丽，原中共中央政治局常委、原中纪委书记吴官正，中共中央政治局委员、国务院副总理刘延东，中共中央政治局委员、国家副主席李源潮，中央政治局委员、中央组织部部长赵乐际也分别委托打来电话，对江元生院士的逝世表示深切哀悼，对其亲属表示亲切慰问，并委托代送花圈。
    致电慰问并送来花篮、花圈的教育部、中国科学院以及相关省市领导有袁贵仁、白春礼、罗志军、梁保华、姚建年、李静海、杨新力、曹卫星、徐南平等。　　

    中共中央组织部、教育部、中国科学院、中共江苏省委、江苏省人民政府、江苏省委组织部、江苏省教育厅等单位发来唁电或送来花圈。
    南京大学党委书记洪银兴，校长陈骏，校内外53位两院院士，兄弟高校、科研院所领导，江西宜春市委、市政府，以及江元生院士的生前好友、同事、学生、亲属也发来唁电、唁函或送来花篮、花圈。
    中科院院士、南京大学校长陈骏，原南京大学校长曲钦岳院士，原南京大学代校长陈懿院士，游效曾院士、伍荣生院士、张淑仪院士、苏定强院士、孙义隧院士、陈洪渊院士、方成院士、张全兴院士、方维海院士、段雪院士、吴云东院士，南京大学原党委书记韩星臣，上海中医药大学校长陈凯先院士，江苏省教育厅厅长沈健以及相关部门、院系、兄弟院校、单位代表，江元生院士的生前好友、同事、学生、亲属和家乡代表参加了遗体告别仪式。