内容:论文
类型:全部985211其它国外课题组
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学校:全部复旦大学上海交通大学同济大学
学院:全部化学化工学院药学院医学院化学与化工学院生物医学工程学院生命科学技术学院农业与生物学院
  • 近日,上海交通大学生命科学技术学院、微生物代谢国家重点实验室白林泉团队深入解析了抗糖尿病药物阿卡波糖生物合成机制,通过有效的代谢工程策略进一步提高了阿卡波糖产量。相关研究成果以“A severe leakage of intermediates to shunt products in acarbose biosynthesis”为题发表于Nature Communications杂志上。上海交通大学博士研究生赵芹芹为论文第一作者,白林泉教授为通讯作者,该文作者还包括邓子新院士、塔里木大学张利莉教授等。

  • 花粉是开花植物的雄配子体,在植物有性生殖、物种繁衍以及粮食生产中扮演重要角色。花粉形态多样、具有物种特异性,是植物分类的重要参考依据之一。然而,花粉形态物种多样性的形成机制不清楚,是植物学领域长期没有解决的重要科学问题。花粉萌发孔是花粉表面没有坚硬外壁覆盖的区域,在授粉期间具有促进花粉吸水和花粉管萌发的作用。花粉萌发孔特征主要由大小、形状、位置和数量等决定。双子叶植物花粉最典型的萌发孔是在花粉表面等距平行排列的三个花粉沟组成;而单子叶植物的特征性萌发孔是在远端分布的单个萌发孔(图1)。

  • 近日,上海交通大学生命科学技术学院、微生物代谢国家重点实验室董涛团队发现细菌Ⅵ型分泌系统(T6SS)可以分泌一种新型的具有分子内伴侣的核酸酶毒素,并揭示了该毒素蛋白的分泌和自剪切机制。相关研究成果以“Intramolecular chaperone-mediated secretion of an Rhs effector toxin by a type VI secretion system”为题发表于Nature Communications杂志上。上海交通大学博士研究生裴同同、李浩和硕士研究生梁小夜

  • 本研究解析了新发现的II型DNA硫化修饰系统中的半胱氨酸脱硫酶SspA(来源于弧菌)与底物半胱氨酸的复合物晶体结构,分辨率为1.8埃。结构揭示SspA通过其天冬酰胺N150和精氨酸R340残基来识别底物半胱氨酸,如果将这两个残基突变则会严重破坏细菌的DNA硫化修饰。在结构中,SspA的活性位点半胱氨酸C314与底物半胱氨酸的距离长达8.9埃,这就产生了一个有趣的问题——SspA是怎么催化脱硫反应的?通过计算机分子动力学模拟,作者发现SspA的活性位点半胱氨酸C314在催化过程中向底物半胱氨酸移动了5.5埃

  • 酰基链长为六到十个碳原子的中链脂肪酸(MCFAs, C6–C10)及衍生物具有独特的应用价值。与长链组分相比,中链烷烃/烯烃及脂肪酸酯更适合用来替代汽油等现有化石燃料;中链脂肪酸还具有抗菌、免疫调控等效果,使相关衍生物广泛应用于食品、药物生产中。近年来脂肪酸的微生物合成取得了许多进展,但产物中应用价值更高的中链脂肪酸含量仍然较低。硫酯酶是脂肪酸合成过程中链长控制的关键酶,对硫酯酶进行底物选择性的定向设计是提高中链脂肪酸合成能力的关键。

  • 近日,上海交通大学生命科学技术学院、微生物代谢国家重点实验室董涛团队揭示了细菌如何应对外来攻击所采用的多种防御策略,阐明了一种独特的细菌间“以牙还牙”(Tit-for-tat)的作用机制。相关研究成果以“Differential cellular response to translocated toxic effectors and physical penetration by the type VI secretion system”为题发表于Cell Press旗下Cell Reports杂志。上

  • 近日,上海交通大学生命科学技术学院、微生物代谢国家重点实验室科研团队首次在原核生物构建了人工无膜细胞区室,揭示了类蛛丝蛋白、节肢弹性蛋白等固有无序蛋白液-液相分离区室化的生物大分子机制,建立了荧光蛋白、酶等蛋白融合共定位至区室的功能化平台。相关研究成果以“Formation and functionalization of membraneless compartments in Escherichia coli”为题发表于Nature Chemical Biology杂志。上海交通大学研究生韦绍鹏、胡春

  • 近日,《Microbiome》杂志在线发表了上海交通大学科研团队研究成果“Microbial succession during the transition from active to inactive stages of deep-sea hydrothermal vent sulfide chimneys” ,上海交通大学生命科学技术学院博士生侯佳林为第一作者,生命科学技术学院肖湘教授和海洋学院王风平教授为共同通讯作者,来自美国伍兹霍尔海洋研究所 (WHOI) 的Stefan Sievert博士为

  • 近日,生物化学与分子生物学领域权威期刊《Nucleic Acids Research》发表了上海交通大学生命科学技术学院、微生物代谢国家重点实验室邓子新团队贺新义研究员和赵一雷教授在DNA硫修饰领域联合领衔,与复旦大学甘建华研究员课题组共同合作的最新研究成果——“DNA backbone interactions impact the sequence specificity of DNA sulfur-binding domains: revelations from structural analys

  • 7月9日,国际顶级学术刊物《细胞》正式发表了大规模临床肺腺癌蛋白质组草图绘制工作。该工作由中科院上海药物研究所牵头, 联合军事科学院军事医学研究院、国家蛋白质科学中心(北京)、国家癌症中心/中国医学科学院肿瘤医院、上海交通大学等多家单位,在国际上首次对肺腺癌开展了大规模、高通量、系统性的全景蛋白质组学研究。上海交通大学生命科学技术学院生物信息学与生物统计学系李婧教授为共同通讯作者,上海交通大学博士生马一鸣为共同第一作者,课题组多名研究生参与了本项目联合攻关。项目研究的组学大数据分析得到了上海交通大学网络

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