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133448-22-3,标记肽Boc-E(OBzl)GR-7-氨基-4-甲基香豆素,Boc-Glu(OBzl)-Gly-Arg-AMC,Boc-E(OBzl)-GR-AMC,杭州专肽生物的产品

标记肽Boc-E(OBzl)GR-7-氨基-4-甲基香豆素

凝血因子IXa和XIIa以及胰蛋白酶和大豆胰蛋白酶样酶的底物。

编号:144773

CAS号:133448-22-3

单字母:Boc-E(OBzl)-GR-AMC

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  • 编号:144773
    中文名称:标记肽Boc-E(OBzl)GR-7-氨基-4-甲基香豆素
    英文名:Boc-Glu(OBzl)-Gly-Arg-AMC
    CAS号:133448-22-3
    单字母:Boc-E(OBzl)-GR-AMC
    三字母:Boc

    N端Boc保护;叔丁氧羰基或叔丁氧羰基(Boc)是胺的保护基团。Boc基团可用强酸去除,如用三氟乙酸在二氯甲烷中去除,或用HCl在甲醇中去除。

    -Glu(OBzl)

    暂无说明

    -Gly

    甘氨酸:glycine。系统命名为 2-氨基乙酸。是编码氨基酸中没有旋光性的最简单的氨基酸,因具有甜味而得名。符号:G,Gly。

    -Arg

    L-精氨酸:arginine。系统命名为(2S)-氨基-5-胍基戊酸。在生理条件下带正电荷,为编码氨基酸。是幼小哺乳动物的必需氨基酸。符号:R,Arg。

    -AMC

    7-氨基-4-甲基香豆素(AMC或Amc)是一种荧光染料,其激发波长为350纳米,发射波长为450纳米。

    氨基酸个数:3
    分子式:C35H45O9N7
    平均分子量:707.77
    精确分子量:707.33
    等电点(PI):-
    pH=7.0时的净电荷数:1
    平均亲水性:3
    疏水性值:-2.45
    消光系数:-
    来源:人工化学合成,仅限科学研究使用,不得用于人体。
    盐体系:可选TFA、HAc、HCl或其它
    储存条件:负80℃至负20℃
    标签:酶底物肽(Substrate Peptide)    AMC修饰肽    三肽    侧链保护基肽   

  •  Caspase酶对应的底物,Caspases(半胱氨酸天冬氨酸蛋白酶,半胱氨酸依赖性天冬氨酸定向蛋白酶)是一类蛋白酶家族,其功能与凋亡(程序性细胞死亡),坏死和发烧(炎症)的过程密切相关。

           什么是胱天蛋白酶?

          胱天蛋白酶(Caspases)是含半胱氨酸的天冬氨酸蛋白水解酶,它们是为细胞凋亡的主要介质。多种受体,例如TNF-α 受体,FasL受体,TLR和死亡受体,以及Bcl-2和凋亡抑制剂(IAP)蛋白家族参与并调节该caspase依赖性凋亡途径。一旦Caspase受到上游信号(外部或内在)刺激被激活,即会参与执行下游蛋白底物的水解作用,并触发一系列事件,导致细胞分解,死亡,吞噬作用和细胞碎片的清除。

          人Caspases酶

          人的Caspases家族基于序列相似性和生物学功能等共性主要可分为三大类:第一类由具有长胱天蛋白酶募集结构域的“炎症”胱天蛋白酶组成,他们对P4位上的较大的芳香族或疏水性残基具有亲和力。第二类由具有短的前体结构域的“细胞凋亡效应”胱天蛋白酶组成,而第三类由具有长的前提结构域的Pap位置具有亮氨酸或缬氨酸底物亲和力的“凋亡引发剂”胱天蛋白酶组成(表1)。

           表1. 人胱天蛋白酶的功能分类:

    细胞死亡途径 半胱天冬酶类型 酵素 物种
    细胞凋亡 启动器 Caspases 2 人与鼠
    细胞凋亡 启动器 Caspases 8 人与鼠
    细胞凋亡 启动器 Caspases 9 人与鼠
    细胞凋亡 启动器 Caspases 10 人的
    细胞凋亡 效应器 Caspases 3 人与鼠
    细胞凋亡 效应器 Caspases 6 人与鼠
    细胞凋亡 效应器 Caspases 6 人与鼠
    细胞焦亡 炎性的 Caspases 1 人与鼠
    细胞焦亡 炎性的 Caspases 4 人的
    细胞焦亡 炎性的 Caspases 5 人的

           启动器Caspase和效应器Caspase酶

          根据其在凋亡胱天蛋白酶途径中的作用,胱天蛋白酶可分为两类:启动器和效应器Caspase酶。启动器和效应器Caspas酶都具有由小亚基和大亚基组成的催化位点,Caspase酶的识别位

          凋亡启动器Caspase酶,例如caspase-2,-8,-9和-10可以启动caspase激活级联反应。Caspase-8对于形成死亡诱导信号复合物(DISC)是必不可少的,并且在激活后,Caspase-8激活下游效应子Caspase(例如Caspase 3)并介导线粒体中细胞色素c的释放。Caspase-8已被证明对IETD肽序列具有相对较高的底物选择性。凋亡效应胱天蛋白酶例如Caspase-3,-6和-7虽然不负责启动级联途径,但是当被激活时,它们在级联的中间和后续步骤中起着不可或缺的作用。Caspase-3(CPP32 / apopain)是关键效应器,因为它放大了来自启动器Caspase的信号,使用对Caspase-3有选择性的DEVD肽序列对活化的Caspase-3进行检测,可以检测Caspase-3的活性。

           Caspase酶底物和抑制剂

          Caspase底物和抑制剂由两个关键成分组成:Caspase识别序列和信号产生或蛋白酶抑制基序。不同Caspase识别序列不同,一般由三个或四个氨基酸组成(表2)。Caspase酶识别序列的N端通常有乙酰基(Ac)或碳苯甲氧基(Z)基团修饰,以增强膜的通透性。对应的Caspase识别特定的肽序列为其酶促反应切割位点,释放产生信号或抑制信号的基序。Caspase的显色和荧光底物均以相似的方式起作用,其中底物的信号或颜色强度与蛋白水解活性成正比。

           表2. Caspase的底物及其序列

    多肽 氨基酸序列 对应的Caspase的种类
    IETD Ile-Glu-Thr-Asp Caspase 8,颗粒酶B
    DEVD Asp-Glu-Val-Asp Caspase 3、6、7、8或10
    LEHD Leu-Glu-His-Asp Caspase 9
    VAD Val-Ala-Asp Caspase 1、2、3、6、8、9或10

             Caspase酶的显色底物

          Caspase的显色底物是有Caspase识别序列及生色基团组成,常见的生色团有pNA(对硝基苯胺或4-硝基苯胺),可使用酶标仪或分光光度计在405 nm处进行光密度检测。

           表3. Caspase的显色底物

    底物 Caspase 吸收(nm) 颜色
    Ac-DEVD-pNA * CAS 189950-66-1 * 半胱天冬酶3 405 nm 黄色
    Z-DEVD-pNA 半胱天冬酶3 405 nm 黄色
    Z-IETD-pNA * CAS 219138-21-3 * 半胱天冬酶8,颗粒酶B 405 nm 黄色

           Caspase的荧光底物

          Caspase的荧光底物的结构包含与半胱天冬酶识别相关的荧光团,例如7-氨基-4-甲基香豆素(AMC),7-氨基-4-三氟甲基香豆素(AFC), Rhodamine 110(R110)或ProRed™620。R110的Caspase底物比基于香豆素的Caspase底物(例如AMC和AFC)更敏感,但由于两步裂解过程,其动态范围更窄。 建议将R110标记的Caspase底物用于终点法测定,而将AMC和AFC标记的 Caspase底物用于动力学测定。

          图.从左到右,分别是AMC(7-氨基-4-甲基香豆素),AFC(7-氨基-4-三氟甲基香豆素),Rhodamine 110(R110)和ProRed™620的激发和发射光谱。

           表4.荧光半胱天冬酶底物。

    底物名称 对应的Caspase Ex(nm) Em(nm) ε¹ Φ²
    Ac-DEVD-AFC * CAS 201608-14-2 * 半胱天冬酶3、7 376 482 17000 0.53
    Ac-DEVD-AMC * CAS 169332-61-0 * 半胱天冬酶3、7 341 441 19000 N / D
    Z-DEVD-AFC 半胱天冬酶3、7 376 482 17000 0.53
    Z-DEVD-AMC * CAS 1135416-11-3 * 半胱天冬酶3、7 341 441 19000 N / D
    Z-DEVD-ProRed™620 半胱天冬酶3、7 532 619 N / D N / D
    (Z-DEVD)2 -R110 * CAS 223538-61-2 * 半胱天冬酶3、7 500 522 80000 N / D
    Z-DEVD-ProRed™620 半胱天冬酶3、7 532 619 N / D N / D
    Ac-IETD-AFC * CAS 211990-57-7 * 半胱天冬酶8,颗粒酶B 376 482 17000 0.53
    Z-IETD-AFC * CAS 219138-02-0 * 半胱天冬酶8,颗粒酶B 376 482 17000 0.53

           注意:

            1.ε=在其最大吸收波长处的摩尔消光系数(单位= cm -1-1)。

          2.Φ=水性缓冲液(pH 7.2)中的荧光量子产率。

           Caspase抑制剂

          Caspase抑制剂能与Caspase的活性位点结合并形成可逆或不可逆的连接,通常,Caspase抑制剂的结构由Caspase识别序列,诸如醛(-CHO)或氟甲基酮(-FMK)的官能团组成。具有醛官能团的胱天蛋白酶抑制剂是可逆的,而具有FMK的抑制剂是不可逆的。半胱天冬酶底物和抑制剂都具有较小的细胞毒性作用,因此,它们是研究半胱天冬酶活性的有用工具。

           表5. 可逆和不可逆的Caspase酶抑制剂

    抑制剂 Caspase的种类 是否可逆 Ex(nm) Em(nm)
    Ac-DEVD-CHO * CAS 169332-60-9 * 半胱天冬酶3、7 可逆的 -- --
    Ac-IETD-CHO * CAS 191338-86-0 * 半胱天冬酶8 可逆的 -- --
    mFluor™450-VAD-FMK 半胱天冬酶1,2,3,6,8,9,10 不可逆的 406 445
    mFluor™510-VAD-FMK 半胱天冬酶1,2,3,6,8,9,10 不可逆的 412 505
    FITC-C6-DEVD-FMK 半胱天冬酶3、7 不可逆的 491 516
    FITC-C6-DEVD-FMK 半胱天冬酶3、7 不可逆的 491 516
    FITC-C6-LEHD-FMK 半胱天冬酶9 不可逆的 491 516
    FITC-C6-LEHD-FMK 半胱天冬酶9 不可逆的 491 516
    FAM-VAD-FMK 半胱天冬酶1,2,3,6,8,9,10 不可逆的 493 517
    SRB-VAD-FMK [磺胺丁胺B-VAD-FMK] 半胱天冬酶1,2,3,6,8,9,10 不可逆的 559 577

    多肽AMC标记:定义、原理、应用及注意事项全解析

    多肽AMC标记,全称多肽7-氨基-4-甲基香豆素标记(Peptide 7-Amino-4-Methylcoumarin Labeling),是一种将荧光分子“AMC”通过特异性共价键连接到多肽特定位点的修饰技术。其核心价值在于为多肽赋予可追踪、可定量的荧光特性,使其成为兼具生物活性与检测功能的“荧光探针”,广泛应用于生物医学科研、酶学分析及药物筛选等领域。

    一、核心组件:AMC分子的核心特性

    AMC(7-氨基-4-甲基香豆素)是该标记技术的核心荧光基团,其独特的化学与光学特性决定了标记效果,核心优势包括:

    1. 光学性能稳定:激发波长约340-360 nm,发射波长约440-460 nm,荧光量子产率高,光漂白抗性强,且背景荧光低,能有效提升检测灵敏度;

    2. 反应活性适配:AMC常以“活性酯衍生物”形式(如AMC-NHS酯、AMC-COOH)存在,可与多肽分子末端(N端/C端)或侧链(如赖氨酸的ε-氨基、天冬氨酸/谷氨酸的羧基)发生酰胺化反应,形成稳定的共价键,且对多肽的空间结构破坏极小;

    3. 水溶性适配:AMC分子兼具一定的亲水性与疏水性,标记后不会显著改变多肽的溶解特性,适配后续水性体系的生物实验。

    二、标记原理与核心流程

    多肽AMC标记的核心是“特异性共价偶联”,需在温和条件下进行以保障多肽生物活性,典型流程如下:

    1. 多肽预处理:先通过高效液相色谱(HPLC)等技术纯化目标多肽,去除杂质;同时确认多肽的活性位点(如受体结合位点、酶切位点),避开这些位点选择标记位点(常用N端氨基或C端羧基);

    2. AMC活性酯制备:将AMC与活化试剂(如NHS、DCC)反应,生成高活性的AMC-NHS酯(减少AMC自身聚合,提升与多肽的反应效率);

    3. 偶联反应:在缓冲体系(如PBS缓冲液,pH 7.0-8.0)中混合多肽与AMC活性酯,控制反应温度(25℃或4℃)与时间(2-4小时),让AMC活性酯的活性基团与多肽的氨基/羧基发生酰胺化反应,形成稳定的标记产物;

    4. 纯化与验证:通过HPLC分离未反应的游离AMC、活化试剂及副产物,收集高纯度的AMC标记多肽;再通过质谱(确认分子量是否符合标记后理论值)、荧光光谱(验证荧光信号强度)进行质控,确保标记成功且多肽活性未受影响。

    三、核心应用场景

    AMC标记的核心优势的是“标记后多肽保留生物活性,荧光信号可实时定量检测”,因此主要应用于以下场景:

    1. 蛋白酶活性检测(最核心应用):将AMC标记在多肽底物的蛋白酶特异性识别序列末端,当蛋白酶切割多肽时,AMC基团被释放(游离AMC的荧光强度远高于结合态),通过检测荧光强度的变化速率,可定量分析蛋白酶的活性(如基质金属蛋白酶MMPs、胰蛋白酶、 caspases等的活性检测);

    2. 受体-配体结合分析:用AMC标记多肽配体,与细胞表面或纯化的受体孵育后,通过荧光成像可追踪配体与受体的结合过程,通过荧光强度定量结合亲和力(Kd值);

    3. 药物筛选:针对特定蛋白酶或受体的药物候选分子,以AMC标记多肽为探针,通过荧光信号的变化(如酶活性被抑制时荧光释放减少),高通量筛选药物的抑制/激活活性,评估药物 potency;

    4. 多肽体内/体外追踪:AMC标记的多肽进入细胞或生物体内后,可通过荧光显微镜、小动物活体成像系统等设备,实时观察多肽的分布、转运及代谢过程,为多肽药物的药代动力学研究提供支撑。

    四、关键注意事项

    1. 标记位点选择:必须避开多肽的生物活性中心(如酶切位点、受体结合位点),否则会导致多肽失去原有功能;若多肽含多个氨基/羧基,可通过控制反应摩尔比、pH值实现特异性单点标记;

    2. 反应条件控制:缓冲液pH需严格控制在7.0-8.0(过酸会抑制酰胺化反应,过碱会导致AMC活性酯水解失效);低温反应(4℃)可减少多肽降解,适合不稳定多肽的标记;

    3. 杂质去除:游离AMC会导致背景荧光偏高,影响检测准确性,因此标记后需通过HPLC彻底纯化,确保标记多肽纯度≥95%(科研级)或≥98%(药物研发级);

    4. 多肽稳定性保护:若多肽含半胱氨酸(Cys),需在反应体系中添加少量还原剂(如DTT),避免Cys侧链巯基氧化形成二硫键,影响多肽结构与标记效率;

    5. 荧光检测条件匹配:检测时需根据AMC的光学特性调整激发/发射波长,避免与实验体系中其他荧光物质(如细胞自身荧光、染料)的光谱重叠,减少干扰。

    五、AMC与AFC标记的核心区别(补充说明)

    此前你关注过多肽AFC标记,两者核心差异在于荧光基团的结构与性能,具体对比如下:AMC含“甲基(-CH₃)”,AFC含“三氟甲基(-CF₃)”;AFC的背景荧光更低、光稳定性更强,但合成成本更高;AMC性价比更高,荧光信号强度足够满足多数科研需求,是更常用的基础荧光标记基团。

  • Boc-EGR-AMC, substrate for coagulation factors IXa and XIIa as well as for trypsin and soybean trypsin-like enzyme.

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