Biotin-labeled RGD peptide
编号：113503
CAS号：2022956-45-0
单字母：Biotinyl-Ahx-GRGDS-OH
| 编号: | 113503 |
| 中文名称: | 生物素标记肽Biotin-C6-GRGDS |
| 英文名: | Biotin-C6-GRGDS |
| 英文同义词: | Biotin-LC-GRGDS |
| CAS号: | 2022956-45-0 |
| 单字母: | Biotinyl-Ahx-GRGDS-OH |
| 三字母: | Biotinyl N端生物素标记 -Ahx6-氨基己酸（Linker） -Gly甘氨酸 -Arg精氨酸 -Gly甘氨酸 -Asp天冬氨酸 -Ser丝氨酸 -OHC端羧基 |
| 氨基酸个数: | 6 |
| 分子式: | C33H55N11O12S1 |
| 平均分子量: | 829.92 |
| 精确分子量: | 829.38 |
| 等电点(PI): | 8.2 |
| pH=7.0时的净电荷数: | - |
| 平均亲水性: | 2.1 |
| 疏水性值: | -1.92 |
| 外观与性状: | 白色粉末状固体 |
| 消光系数: | - |
| 来源: | 人工化学合成，仅限科学研究使用，不得用于人体。 |
| 纯度: | 95%、98% |
| 盐体系: | 可选TFA、HAc、HCl或其它 |
| 生成周期: | 2-3周 |
| 储存条件: | 负80℃至负20℃ |
| 标签: | 生物素标记肽(Biotinyl) 氨基酸衍生物肽 RGD、RAD肽 |
GRGDS-amide can be coupled to carrriers by its free N-terminus.
专肽生物合成用于蛋白质-蛋白质相互作用研究的生物素化肽。尽管生物素可以在 N 端或 C 端引入（通过赖氨酸残基），但我们建议使用 N 端修饰，因为它成本低、成功率高、周转时间短且易于操作。因为多肽合成是从 C 端到 N 端合成的，因此，N 端修饰是 SPPS步骤的最后一步，不需要额外的特定缩合步骤。相比之下，C 端修饰需要额外的步骤，并且通常更复杂。当然，原则上生物素可以定位在任何地方。
生物素可以通过多种不同的接头或间隔物与肽分离。尽管如此，还是建议包含一个灵活的间隔物，例如 Ahx（一个 6 碳接头），以使生物素标签更加稳定或灵活。
专肽生物在 N 端或 C 端提供生物素化：生物素-N 端、赖氨酸-生物素-肽中间和赖氨酸-生物素-C 端。
专肽生物还可以使用 Ahx 接头或长碳 (LC) 接头提供生物素化：生物素-Ahx-N 末端、Lys-Ahx-生物素-肽中间、Lys-Ahx-生物素-C-末端。
（生物素结构）
示例：
GRGDS在N端和C端标记生物素的结构展示。
1、GRGDS在N端标记生物素，不增加Ahx 接头
2、GRGDS在N端标记生物素，增加一个Ahx 接头
3、GRGDS在C端标记生物素，不增加Ahx 接头
4、GRGDS在C端标记生物素，增加一个Ahx 接头。
RGD肽-说明
RGD肽是指含有由Arg-Gly-Asp三个氨基酸组成的序列多肽，有直线肽和环肽之分。它们是许多细胞外基质蛋白（如VN、FN、FGN、胶原等）等最小识别短肽序列。
研究发现，RGD序列肽具有广泛的生物活性，可用于心血管疾病、骨质疏松和炎症等疾病的治疗，还可以预防和治疗由细胞粘附异常而导致的肿瘤，尤其是发展性肿瘤的转移；另一方面，RGD 序列肽又可作为兴奋剂，促进损伤的器官与组织的再生、伤口的愈合等等，RGD作为某些整合素的受体，其选择性部分依赖于RGD的构象以及RGD周围的氨基酸残基。
为此，近几年，许多科技工作者合成了一系列RGD三肽、四肽、五肽等，还合成了RGD环肽、双线肽、RGD模拟肽等等。为了满足客户对各种RGD序列肽的需求，专肽生物提供最广泛的RGD序列肽库，以满足科研工作者对RGD肽的需求。
专肽生物提供各种RGD肽的现货，缩短科研工作者的项目时间，例如c(RGDfK)、c(RGDfC)、c(RADyK)、c(RGDyK)、c(RADfC)、环状多肽c(RGDfK)-巯基乙酸、c(RGDfK)-PEG2-巯基乙酸、Mpa-Ahx-c(RGDfK)、环状多肽c(RGDfK)-半胱氨酸、DOTA-c(RGDfK)、NOTA-c(RGDfK)、NOTA-c(RGDyK)、DOTA-c(RGDyK)、E[c(RGDfK)]2、E[c(RGDyK)]2、DDDDD-c(RGDfK)等等，具体可咨询销售人员。
| DOI | 名称 | |
|---|---|---|
| 10.1242/jcs.115.13.2669 | Role of the beta1-integrin cytoplasmic tail in mediating invasin-promoted internalization of Yersinia | 下载 |
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| 10.1091/mbc.e03-09-0700 | The integrin beta1 subunit transmembrane domain regulates phosphatidylinositol 3-kinase-dependent tyrosine phosphorylation of Crk-associated substrate | 下载 |
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多肽Biotin-Ahx-Gly-Arg-Gly-Asp-Ser-COOH的合成步骤：
1、合成CTC树脂：称取0.92g CTC Resin（如初始取代度约为0.72mmol/g）和0.79mmol Fmoc-Ser(tBu)-OH于反应器中，加入适量DCM溶解氨基酸（需要注意，此时CTC树脂体积会增大好几倍，避免DCM溶液过少），再加入1.99mmol DIPEA（Mw：129.1,d：0.740g/ml），反应2-3小时后，可不抽滤溶液，直接加入1ml的HPLC级甲醇，封端半小时。依次用DMF洗涤2次，甲醇洗涤1次，DCM洗涤一次，甲醇洗涤一次，DCM洗涤一次，DMF洗涤2次（这里使用甲醇和DCM交替洗涤，是为了更好地去除其他溶质，有利于后续反应）。得到 Fmoc-Ser(tBu)-CTC Resin。结构图如下：
2、脱Fmoc：加3倍树脂体积的20%Pip/DMF溶液，鼓氮气30分钟，然后2倍树脂体积的DMF 洗涤5次。得到 H2N-Ser(tBu)-CTC Resin 。（此步骤脱除Fmoc基团，茚三酮检测为蓝色，Pip为哌啶）。结构图如下：
3、缩合：取1.99mmol Fmoc-Asp(OtBu)-OH 氨基酸，加入到上述树脂里，加适当DMF溶解氨基酸，再依次加入3.97mmol DIPEA，1.89mmol HBTU。反应30分钟后，取小样洗涤，茚三酮检测为无色。用2倍树脂体积的DMF 洗涤3次树脂。（洗涤树脂，去掉残留溶剂，为下一步反应做准备）。得到Fmoc-Asp(OtBu)-Ser(tBu)-CTC Resin。氨基酸：DIPEA：HBTU：树脂=3：6：2.85：1（摩尔比）。结构图如下：
4、依次循环步骤二、步骤三，依次得到
H2N-Asp(OtBu)-Ser(tBu)-CTC Resin
Fmoc-Gly-Asp(OtBu)-Ser(tBu)-CTC Resin
H2N-Gly-Asp(OtBu)-Ser(tBu)-CTC Resin
Fmoc-Arg(Pbf)-Gly-Asp(OtBu)-Ser(tBu)-CTC Resin
H2N-Arg(Pbf)-Gly-Asp(OtBu)-Ser(tBu)-CTC Resin
Fmoc-Gly-Arg(Pbf)-Gly-Asp(OtBu)-Ser(tBu)-CTC Resin
H2N-Gly-Arg(Pbf)-Gly-Asp(OtBu)-Ser(tBu)-CTC Resin
Fmoc-Ahx-Gly-Arg(Pbf)-Gly-Asp(OtBu)-Ser(tBu)-CTC Resin
以上中间结构，均可在专肽生物多肽计算器-多肽结构计算器中，一键画出。
最后再经过步骤二得到 H2N-Ahx-Gly-Arg(Pbf)-Gly-Asp(OtBu)-Ser(tBu)-CTC Resin，结构如下：
5、生物素反应连接：在上述树脂中，加入适当DMF后，再加入1.99mmol 生物素到树脂中，再加入3.97mmol DIPEA、1.89mmol HBTU，鼓氮气反应30分钟。用2倍树脂体积的DMF 洗涤3次树脂（洗涤树脂，去掉残留溶剂，为下一步反应做准备）。 得到Biotin-Ahx-Gly-Arg(Pbf)-Gly-Asp(OtBu)-Ser(tBu)-CTCResin。 结构如下：
6、切割：6倍树脂体积的切割液（或每1g树脂加8ml左右的切割液），摇床摇晃 2小时，过滤掉树脂，用冰无水乙醚沉淀滤液，并用冰无水乙醚洗涤沉淀物3次，最后将沉淀物放真空干燥釜中，常温干燥24小试，得到粗品Biotin-Ahx-Gly-Arg-Gly-Asp-Ser-COOH。结构图见产品结构图。
切割液选择：1）TFA：H2O=95%：5%
2）TFA：H2O：TIS=95%：2.5%：2.5%
3）三氟乙酸：茴香硫醚：1，2-乙二硫醇：苯酚：水=87.5%：5%：2.5%：2.5%：2.5%
（前两种适合没有容易氧化的氨基酸，例如Trp、Cys、Met。第三种适合几乎所有的序列。）
6、纯化冻干：使用液相色谱纯化，收集目标峰液体，进行冻干，获得蓬松的粉末状固体多肽。不过这时要取小样复测下纯度 是否目标纯度。
7、最后总结：
杭州专肽生物技术有限公司（ALLPEPTIDE https://www.allpeptide.com）主营定制多肽合成业务，提供各类长肽，短肽，环肽，提供各类修饰肽，如：荧光标记修饰（CY3、CY5、CY5.5、CY7、FAM、FITC、Rhodamine B、TAMRA等），功能基团修饰肽（叠氮、炔基、DBCO、DOTA、NOTA等），同位素标记肽（N15、C13），订书肽（Stapled Peptide）,脂肪酸修饰肽（Pal、Myr、Ste），磷酸化修饰肽（P-Ser、P-Thr、P-Tyr），环肽（酰胺键环肽、一对或者多对二硫键环），生物素标记肽，PEG修饰肽，甲基化修饰肽
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