短肽PHSRN已在第9个III型纤连蛋白重复序列中鉴定为协同增强第10个III型重复序列中RGD序列的细胞粘附活性的关键位点。
编号：154228
CAS号：158622-13-0
单字母：H2N-PHSRN-OH
| 编号: | 154228 |
| 中文名称: | 纤维连接蛋白片段Fibronectin Fragment (1376-1380) |
| 英文名: | Fibronectin Fragment (1376-1380) |
| CAS号: | 158622-13-0 |
| 单字母: | H2N-PHSRN-OH |
| 三字母: | H2N N端氨基：N-terminal amino group。在肽或多肽链中含有游离a-氨基的氨基酸一端。在表示氨基酸序列时，通常将N端放在肽链的左边。 -ProL-脯氨酸：proline。系统命名为吡咯烷-(2S)-羧酸。为亚氨基酸。是编码氨基酸。在肽链中有特殊作用，如易形成顺式的肽键等。符号：P，Pro。 -HisL-组氨酸：histidine。系统命名为(2S)-氨基-3-(4-咪唑基)丙酸。其侧链带有弱碱性的咪唑基，为编码氨基酸。是幼小哺乳动物的必需氨基酸。符号：H，His。 -SerL-丝氨酸：serine。系统命名为(2S)-氨基-3-羟基丙酸。是编码氨基酸。因可从蚕丝中获得而得名。符号：S，Ser。在丝原蛋白及某些抗菌素中含有 D-丝氨酸。 -ArgL-精氨酸：arginine。系统命名为(2S)-氨基-5-胍基戊酸。在生理条件下带正电荷，为编码氨基酸。是幼小哺乳动物的必需氨基酸。符号：R，Arg。 -Asn天冬酰胺：asparagine。L-天冬酰胺的系统命名为(2S)-氨基-3-氨酰基丙酸，是编码氨基酸。符号：N，Asn。D-天冬酰胺存在于短杆菌肽A分子中。 -OHC端羧基：C-terminal carboxyl group。在肽或多肽链中含有游离羧基的氨基酸一端。在表示氨基酸序列时，通常将C端放在肽链的右边。 |
| 氨基酸个数: | 5 |
| 分子式: | C24H39N11O8 |
| 平均分子量: | 609.64 |
| 精确分子量: | 609.3 |
| 等电点(PI): | - |
| pH=7.0时的净电荷数: | 2.21 |
| 平均亲水性: | 0.75 |
| 疏水性值: | -2.72 |
| 消光系数: | - |
| 来源: | 人工化学合成，仅限科学研究使用，不得用于人体。 |
| 储存条件: | 负80℃至负20℃ |
| 标签: | 未分类肽 |
The short peptide PHSRN has been identified in the 9th type III fibronectin repeat as a key site for synergistic enhancement of the cell-adhesive activity of the RGD sequence in the 10th type III repeat. However, this synthetic peptide mediated a synergistic enhancement of cell-adhesive activity only when it was covalently linked to the corresponding site of a non-active recombinant construct consisting of the 8th and 10th type III fibronectin repeats. Miyamoto et al. observed that PHSRN ameliorates the inhibitory effects of conventional peritoneal dialysis fluids on peritoneal wound healing.
多肽H2N-Pro-His-Ser-Arg-Asn-COOH的合成步骤：
1、合成CTC树脂：称取1.81g CTC Resin（如初始取代度约为1.1mmol/g）和2.39mmol Fmoc-Asn(Trt)-OH于反应器中，加入适量DCM溶解氨基酸（需要注意，此时CTC树脂体积会增大好几倍，避免DCM溶液过少），再加入5.97mmol DIPEA（Mw：129.1,d：0.740g/ml），反应2-3小时后，可不抽滤溶液，直接加入1ml的HPLC级甲醇，封端半小时。依次用DMF洗涤2次，甲醇洗涤1次，DCM洗涤一次，甲醇洗涤一次，DCM洗涤一次，DMF洗涤2次（这里使用甲醇和DCM交替洗涤，是为了更好地去除其他溶质，有利于后续反应）。得到 Fmoc-Asn(Trt)-CTC Resin。结构图如下：
2、脱Fmoc：加3倍树脂体积的20%Pip/DMF溶液，鼓氮气30分钟，然后2倍树脂体积的DMF 洗涤5次。得到 H2N-Asn(Trt)-CTC Resin 。（此步骤脱除Fmoc基团，茚三酮检测为蓝色，Pip为哌啶）。结构图如下：
3、缩合：取5.97mmol Fmoc-Arg(Pbf)-OH 氨基酸，加入到上述树脂里，加适当DMF溶解氨基酸，再依次加入11.95mmol DIPEA，5.67mmol HBTU。反应30分钟后，取小样洗涤，茚三酮检测为无色。用2倍树脂体积的DMF 洗涤3次树脂。（洗涤树脂，去掉残留溶剂，为下一步反应做准备）。得到Fmoc-Arg(Pbf)-Asn(Trt)-CTC Resin。氨基酸：DIPEA：HBTU：树脂=3：6：2.85：1（摩尔比）。结构图如下：
4、依次循环步骤二、步骤三，依次得到
H2N-Arg(Pbf)-Asn(Trt)-CTC Resin
Fmoc-Ser(tBu)-Arg(Pbf)-Asn(Trt)-CTC Resin
H2N-Ser(tBu)-Arg(Pbf)-Asn(Trt)-CTC Resin
Fmoc-His(Trt)-Ser(tBu)-Arg(Pbf)-Asn(Trt)-CTC Resin
H2N-His(Trt)-Ser(tBu)-Arg(Pbf)-Asn(Trt)-CTC Resin
Fmoc-Pro-His(Trt)-Ser(tBu)-Arg(Pbf)-Asn(Trt)-CTC Resin
以上中间结构，均可在专肽生物多肽计算器-多肽结构计算器中，一键画出。
最后再经过步骤二得到 H2N-Pro-His(Trt)-Ser(tBu)-Arg(Pbf)-Asn(Trt)-CTC Resin，结构如下：
5、切割：6倍树脂体积的切割液（或每1g树脂加8ml左右的切割液），摇床摇晃 2小时，过滤掉树脂，用冰无水乙醚沉淀滤液，并用冰无水乙醚洗涤沉淀物3次，最后将沉淀物放真空干燥釜中，常温干燥24小试，得到粗品H2N-Pro-His-Ser-Arg-Asn-COOH。结构图见产品结构图。
切割液选择：1）TFA：H2O=95%：5%、TFA：H2O=97.5%：2.5%
2）TFA：H2O：TIS=95%：2.5%：2.5%
3）三氟乙酸：茴香硫醚：1，2-乙二硫醇：苯酚：水=87.5%：5%：2.5%：2.5%：2.5%
（前两种适合没有容易氧化的氨基酸，例如Trp、Cys、Met。第三种适合几乎所有的序列。）
6、纯化冻干：使用液相色谱纯化，收集目标峰液体，进行冻干，获得蓬松的粉末状固体多肽。不过这时要取小样复测下纯度 是否目标纯度。
7、最后总结：
杭州专肽生物技术有限公司（ALLPEPTIDE https://www.allpeptide.com）主营定制多肽合成业务，提供各类长肽，短肽，环肽，提供各类修饰肽，如：荧光标记修饰（CY3、CY5、CY5.5、CY7、FAM、FITC、Rhodamine B、TAMRA等），功能基团修饰肽（叠氮、炔基、DBCO、DOTA、NOTA等），同位素标记肽（N15、C13），订书肽（Stapled Peptide）,脂肪酸修饰肽（Pal、Myr、Ste），磷酸化修饰肽（P-Ser、P-Thr、P-Tyr），环肽（酰胺键环肽、一对或者多对二硫键环），生物素标记肽，PEG修饰肽，甲基化修饰肽
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