400-998-5282
专注多肽 服务科研
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caspase-3的荧光底物。 它包含杆状病毒胱天蛋白酶抑制剂p35的DQMD肽序列。
编号：141749
CAS号：1926163-45-2
单字母：Z-DQMD-AFC
| 编号: | 141749 |
| 中文名称: | 四肽Z-Asp-Gln-Met-Asp-7-氨基-4-三氟甲基香豆素 |
| 英文名: | Z-Asp-Gln-Met-Asp-AFC |
| CAS号: | 1926163-45-2 |
| 单字母: | Z-DQMD-AFC |
| 三字母: | Cbz N端Cbz保护，苄氧羰基（Cbz，Z） -AspL-天冬氨酸：aspartic acid。系统命名为(2S)-氨基-丁二酸。是编码氨基酸，又是神经递质。符号：D，Asp。D-天冬氨酸存在于多种细菌的细胞壁和短杆菌肽A中。 -GlnL-谷氨酰胺：glutamine。系统命名为(2S)-氨基-4-氨酰基丁酸，是编码氨基酸。符号：GIn，Q。 -MetL-甲硫氨酸：methionine又称“蛋氨酸”。系统命名为(2S)-氨基-4-甲硫基丁酸。是编码氨基酸。是哺乳动物的必需氨基酸。符号：M，Met。 -AspL-天冬氨酸：aspartic acid。系统命名为(2S)-氨基-丁二酸。是编码氨基酸，又是神经递质。符号：D，Asp。D-天冬氨酸存在于多种细菌的细胞壁和短杆菌肽A中。 -AFC7-氨基-4-三氟甲基香豆素（AFC）是一种荧光染料，其激发波长为376纳米，发射波长为480纳米。 |
| 氨基酸个数: | 4 |
| 分子式: | C36H39O13N5S1F3 |
| 平均分子量: | 838.78 |
| 精确分子量: | 838.22 |
| 等电点(PI): | - |
| pH=7.0时的净电荷数: | -2 |
| 平均亲水性: | 1.225 |
| 疏水性值: | -2.15 |
| 消光系数: | - |
| 来源: | 人工化学合成，仅限科学研究使用，不得用于人体。 |
| 储存条件: | 负80℃至负20℃ |
| 标签: | CBZ修饰肽 AFC修饰肽 |
Ac-DQMD-AFC, fluorogenic substrate for caspase-3. It contains the DQMD peptide sequence of the baculovirus caspase inhibitor p35.
7-Amino-4-trifluoromethyl-coumarin (AFC) is fluorophor with an excitation at 376 nm ▉ and emission of 480 nm ▉.
| DOI | 名称 | |
|---|---|---|
| 10.1074/jbc.272.15.9677 | Substrate specificities of caspase family proteases | 下载 |
| 10.1021/bi980893w | Interaction of the baculovirus anti-apoptotic protein p35 with caspases. Specificity, kinetics, and characterization of the caspase/p35 complex | 下载 |
多肽Cbz-Asp-Gln-Met-Asp-AFC的合成步骤：
1、合成CTC树脂：称取1.42g CTC Resin（如初始取代度约为1.04mmol/g）和1.77mmol Fmoc-Asp(OtBu)-OH于反应器中，加入适量DCM溶解氨基酸（需要注意，此时CTC树脂体积会增大好几倍，避免DCM溶液过少），再加入4.43mmol DIPEA（Mw：129.1,d：0.740g/ml），反应2-3小时后，可不抽滤溶液，直接加入1ml的HPLC级甲醇，封端半小时。依次用DMF洗涤2次，甲醇洗涤1次，DCM洗涤一次，甲醇洗涤一次，DCM洗涤一次，DMF洗涤2次（这里使用甲醇和DCM交替洗涤，是为了更好地去除其他溶质，有利于后续反应）。得到 Fmoc-Asp(OtBu)-CTC Resin。结构图如下：
2、脱Fmoc：加3倍树脂体积的20%Pip/DMF溶液，鼓氮气30分钟，然后2倍树脂体积的DMF 洗涤5次。得到 H2N-Asp(OtBu)-CTC Resin 。（此步骤脱除Fmoc基团，茚三酮检测为蓝色，Pip为哌啶）。结构图如下：
3、缩合：取4.43mmol Fmoc-Met-OH 氨基酸，加入到上述树脂里，加适当DMF溶解氨基酸，再依次加入8.86mmol DIPEA，4.21mmol HBTU。反应30分钟后，取小样洗涤，茚三酮检测为无色。用2倍树脂体积的DMF 洗涤3次树脂。（洗涤树脂，去掉残留溶剂，为下一步反应做准备）。得到Fmoc-Met-Asp(OtBu)-CTC Resin。氨基酸：DIPEA：HBTU：树脂=3：6：2.85：1（摩尔比）。结构图如下：
4、依次循环步骤二、步骤三，依次得到
H2N-Met-Asp(OtBu)-CTC Resin
Fmoc-Gln(Trt)-Met-Asp(OtBu)-CTC Resin
H2N-Gln(Trt)-Met-Asp(OtBu)-CTC Resin
Fmoc-Asp(OtBu)-Gln(Trt)-Met-Asp(OtBu)-CTC Resin
以上中间结构，均可在专肽生物多肽计算器-多肽结构计算器中，一键画出。
最后再经过步骤二得到 H2N-Asp(OtBu)-Gln(Trt)-Met-Asp(OtBu)-CTC Resin，结构如下：
5、苯甲氧羰酰琥珀酰亚胺Cbz-Cl反应连接：在上述树脂中，加入适当DMF后，再加入4.43mmol 苯甲氧羰酰琥珀酰亚胺Cbz-Cl到树脂中，再加入8.86mmol DIPEA、4.21mmol HBTU，鼓氮气反应30分钟。用2倍树脂体积的DMF 洗涤3次树脂（洗涤树脂，去掉残留溶剂，为下一步反应做准备）。 得到Cbz-Asp(OtBu)-Gln(Trt)-Met-Asp(OtBu)-CTC Resin。 结构如下：
6、全保护切割：配置0.5%TFA/DCM溶液，溶液体积约为树脂体积的3倍。再次用DCM洗涤树脂2遍（去除残留DMF），后将配置好的溶液倒入到反应器中，反应30分钟。抽滤树脂，收集滤液（此时多肽已经从树脂上分离，存在于滤液中）。多肽序列为 Cbz-Asp(OtBu)-Gln(Trt)-Met-Asp(OtBu)-CTC Resin。 在滤液中添加DIEPA，调PH至7-8。用饱和NaHCO3洗涤滤液，分离出DCM层溶液。可适当旋蒸DCM层溶液，减少有机溶剂。再次加入1或2倍体积的乙酸乙酯，用稀HCl溶液调PH至微酸性，将多肽从DCM层萃取到乙酸乙酯层。用饱和NaCl洗涤2次乙酸乙酯层。用无水硫酸镁吸收乙酸乙酯层的水分。通过减压旋蒸，直接将乙酸乙酯完全旋蒸掉，得到晶体状固体多肽，用于下一步C端反应。或通过减压旋蒸保留适量乙酸乙酯的溶液体积，加入冰乙醚析出 多肽，然后对多肽进行烘干操作即可用于下一步C端反应。Cbz-Asp(OtBu)-Gln(Trt)-Met-Asp(OtBu)-COOH的结构图如下。
7、7-氨基-4-三氟甲基香豆素反应连接：在上述树脂中，加入适当DMF后，再加入4.43mmol 7-氨基-4-三氟甲基香豆素到树脂中，再加入8.86mmol DIPEA、4.21mmol HBTU，鼓氮气反应30分钟。用2倍树脂体积的DMF 洗涤3次树脂（洗涤树脂，去掉残留溶剂，为下一步反应做准备）。 得到 Cbz-Asp(OtBu)-Gln(Trt)-Met-Asp(OtBu)-AFC。 结构如下：
8、切割：6倍树脂体积的切割液（或每1g树脂加8ml左右的切割液），摇床摇晃 2小时，过滤掉树脂，用冰无水乙醚沉淀滤液，并用冰无水乙醚洗涤沉淀物3次，最后将沉淀物放真空干燥釜中，常温干燥24小试，得到粗品Cbz-Asp-Gln-Met-Asp-AFC。结构图见产品结构图。
切割液选择：1）TFA：H2O=95%：5%
2）TFA：H2O：TIS=95%：2.5%：2.5%
3）三氟乙酸：茴香硫醚：1，2-乙二硫醇：苯酚：水=87.5%：5%：2.5%：2.5%：2.5%
（前两种适合没有容易氧化的氨基酸，例如Trp、Cys、Met。第三种适合几乎所有的序列。）
9、纯化冻干：使用液相色谱纯化，收集目标峰液体，进行冻干，获得蓬松的粉末状固体多肽。不过这时要取小样复测下纯度 是否目标纯度。
10、最后总结：
杭州专肽生物技术有限公司（ALLPEPTIDE https://www.allpeptide.com）主营定制多肽合成业务，提供各类长肽，短肽，环肽，提供各类修饰肽，如：荧光标记修饰（CY3、CY5、CY5.5、CY7、FAM、FITC、Rhodamine B、TAMRA等），功能基团修饰肽（叠氮、炔基、DBCO、DOTA、NOTA等），同位素标记肽（N15、C13），订书肽（Stapled Peptide）,脂肪酸修饰肽（Pal、Myr、Ste），磷酸化修饰肽（P-Ser、P-Thr、P-Tyr），环肽（酰胺键环肽、一对或者多对二硫键环），生物素标记肽，PEG修饰肽，甲基化修饰肽等。
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