使用 Aβ42 亚肽的实验表明，如 Ying 和同事所描述的，由抗体 A8 鉴定的表位位于 Aβ 的 1-6 区域内。该抗体对分子量范围为 16.5-25 kDa 的可溶性 Aβ42 寡聚体显示出高亲和力，并在来自加速衰老的 SAMP 8 小鼠的脑切片中检测到目标抗原。序列的酰胺化或乙酰化和酰胺化形式用于例如定量结构保留关系 (QSRR) 实验。正如 Kaliszan 及其同事所报告的那样，后者可以预测肽的反相高效液相色谱 (HPLC) 保留。
编号：200042
CAS号：903883-21-6
单字母：H2N-DAEFRH-CONH2
| 编号: | 200042 |
| 中文名称: | 淀粉肽Amyloid β-Protein (1-6) amide、Aβ1-6 amide |
| CAS号: | 903883-21-6 |
| 单字母: | H2N-DAEFRH-CONH2 |
| 三字母: | H2N N端氨基：N-terminal amino group。在肽或多肽链中含有游离a-氨基的氨基酸一端。在表示氨基酸序列时，通常将N端放在肽链的左边。 -AspL-天冬氨酸：aspartic acid。系统命名为(2S)-氨基-丁二酸。是编码氨基酸，又是神经递质。符号：D，Asp。D-天冬氨酸存在于多种细菌的细胞壁和短杆菌肽A中。 -Ala丙氨酸：alanine。L-丙氨酸的系统命名为(2S)-氨基丙酸，是编码氨基酸，也叫L-α-丙氨酸。符号：A，Ala。D-丙氨酸存在于多种细菌细胞壁的糖肽中。β-丙氨酸是维生素泛酸和辅酶A的组分。 -GluL-谷氨酸：glutamic acid。系统命名为(2S)-氨基-戊二酸。是编码氨基酸。符号：E，Glu。D-谷氨酸存在于多种细菌的细胞壁和某些细菌杆菌肽中。 -PheL-苯丙氨酸：phenylalanine。系统命名为(2S)-氨基-3-苯基丙酸。是编码氨基酸。是哺乳动物的必需氨基酸。符号：F，Phe。 -ArgL-精氨酸：arginine。系统命名为(2S)-氨基-5-胍基戊酸。在生理条件下带正电荷，为编码氨基酸。是幼小哺乳动物的必需氨基酸。符号：R，Arg。 -HisL-组氨酸：histidine。系统命名为(2S)-氨基-3-(4-咪唑基)丙酸。其侧链带有弱碱性的咪唑基，为编码氨基酸。是幼小哺乳动物的必需氨基酸。符号：H，His。 -CONH2C端酰胺化 |
| 氨基酸个数: | 6 |
| 分子式: | C33H48N12O10 |
| 平均分子量: | 772.81 |
| 精确分子量: | 772.36 |
| 等电点(PI): | 7.56 |
| pH=7.0时的净电荷数: | 0.21 |
| 平均亲水性: | 0.91666666666667 |
| 疏水性值: | -1.68 |
| 消光系数: | - |
| 来源: | 人工化学合成，仅限科学研究使用，不得用于人体。 |
| 储存条件: | 负80℃至负20℃ |
| 标签: | 未分类肽 |
Experiments using sub-peptides of Aβ42 revealed that the epitope identified by the antibody A8, as described by Ying and coworkers, lies within the 1-6 region of Aβ. The antibody displays high affinity for soluble Aβ42 oligomers in the molecular weight range of 16.5-25 kDa, and detected target antigen in brain sections from senescence-accelerated SAMP 8 mice. Amidated or acetylated and amidated forms of the sequence were used for example for quantitative structure retention relationships (QSRR) experiments. The latter could allow prediction of reversed-phase high-performance liquid chromatography (HPLC) retention of peptides, as reported by Kaliszan and coworkers.
| DOI | 名称 | |
|---|---|---|
| 10.1089/hyb.2009.0015 | Preparation and characterization of a monoclonal antibody with high affinity for soluble Abeta oligomers | 下载 |
| 10.1002/pmic.200400973 | Prediction of high-performance liquid chromatography retention of peptides with the use of quantitative structure-retention relationships | 下载 |
多肽H2N-Asp-Ala-Glu-Phe-Arg-His-NH2的合成步骤：
1、合成MBHA树脂：取若干克的MBHA树脂（如初始取代度为0.5mmol/g）和1倍树脂摩尔量的Fmoc-Linker-OH加入到反应器中，加入DMF，搅拌使氨基酸完全溶解。再加入树脂2倍量的DIEPA，搅拌混合均匀。再加入树脂0.95倍量的HBTU，搅拌混合均匀。反应3-4小时后，用DMF洗涤3次。用2倍树脂体积的10%乙酸酐/DMF 进行封端30分钟。然后再用DMF洗涤3次，甲醇洗涤2次，DCM洗涤2次，再用甲醇洗涤2次。真空干燥12小时以上，得到干燥的树脂{Fmoc-Linker-MHBA Resin}，测定取代度。这里测得取代度为 0.3mmol/g。结构如下图：
2、脱Fmoc：取1.66g的上述树脂，用DCM或DMF溶胀20分钟。用DMF洗涤2遍。加3倍树脂体积的20%Pip/DMF溶液，鼓氮气30分钟，然后2倍树脂体积的DMF 洗涤5次。得到 H2N-Linker-MBHA Resin 。（此步骤脱除Fmoc基团，茚三酮检测为蓝色，Pip为哌啶）。结构图如下：
3、缩合：取1.49mmol Fmoc-His(Trt)-OH 氨基酸，加入到上述树脂里，加适当DMF溶解氨基酸，再依次加入2.99mmol DIPEA，1.42mmol HBTU。反应30分钟后，取小样洗涤，茚三酮检测为无色。用2倍树脂体积的DMF 洗涤3次树脂。（洗涤树脂，去掉残留溶剂，为下一步反应做准备）。得到Fmoc-His(Trt)-Linker-MBHA Resin。氨基酸：DIPEA：HBTU：树脂=3：6：2.85：1（摩尔比）。结构图如下：
4、依次循环步骤二、步骤三，依次得到
H2N-His(Trt)-Linker-MBHA Resin
Fmoc-Arg(Pbf)-His(Trt)-Linker-MBHA Resin
H2N-Arg(Pbf)-His(Trt)-Linker-MBHA Resin
Fmoc-Phe-Arg(Pbf)-His(Trt)-Linker-MBHA Resin
H2N-Phe-Arg(Pbf)-His(Trt)-Linker-MBHA Resin
Fmoc-Glu(OtBu)-Phe-Arg(Pbf)-His(Trt)-Linker-MBHA Resin
H2N-Glu(OtBu)-Phe-Arg(Pbf)-His(Trt)-Linker-MBHA Resin
Fmoc-Ala-Glu(OtBu)-Phe-Arg(Pbf)-His(Trt)-Linker-MBHA Resin
H2N-Ala-Glu(OtBu)-Phe-Arg(Pbf)-His(Trt)-Linker-MBHA Resin
Fmoc-Asp(OtBu)-Ala-Glu(OtBu)-Phe-Arg(Pbf)-His(Trt)-Linker-MBHA Resin
以上中间结构，均可在专肽生物多肽计算器-多肽结构计算器中，一键画出。
最后再经过步骤二得到 H2N-Asp(OtBu)-Ala-Glu(OtBu)-Phe-Arg(Pbf)-His(Trt)-Linker-MBHA Resin，结构如下：
5、切割：6倍树脂体积的切割液（或每1g树脂加8ml左右的切割液），摇床摇晃 2小时，过滤掉树脂，用冰无水乙醚沉淀滤液，并用冰无水乙醚洗涤沉淀物3次，最后将沉淀物放真空干燥釜中，常温干燥24小试，得到粗品H2N-Asp-Ala-Glu-Phe-Arg-His-NH2。结构图见产品结构图。
切割液选择：1）TFA：H2O=95%：5%
2）TFA：H2O：TIS=95%：2.5%：2.5%
3）三氟乙酸：茴香硫醚：1，2-乙二硫醇：苯酚：水=87.5%：5%：2.5%：2.5%：2.5%
（前两种适合没有容易氧化的氨基酸，例如Trp、Cys、Met。第三种适合几乎所有的序列。）
6、纯化冻干：使用液相色谱纯化，收集目标峰液体，进行冻干，获得蓬松的粉末状固体多肽。不过这时要取小样复测下纯度 是否目标纯度。
7、最后总结：
杭州专肽生物技术有限公司（ALLPEPTIDE https://www.allpeptide.com）主营定制多肽合成业务，提供各类长肽，短肽，环肽，提供各类修饰肽，如：荧光标记修饰（CY3、CY5、CY5.5、CY7、FAM、FITC、Rhodamine B、TAMRA等），功能基团修饰肽（叠氮、炔基、DBCO、DOTA、NOTA等），同位素标记肽（N15、C13），订书肽（Stapled Peptide）,脂肪酸修饰肽（Pal、Myr、Ste），磷酸化修饰肽（P-Ser、P-Thr、P-Tyr），环肽（酰胺键环肽、一对或者多对二硫键环），生物素标记肽，PEG修饰肽，甲基化修饰肽
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