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396716-24-8,HSV-1酶底物多肽:HSV-1-amide UL 26 Open Reading Frame (2,H2N-His-Thr-Tyr-Leu-Gln-Ala-Ser-Glu-Lys-Phe-Lys-Met-Trp-Gly-NH2,H2N-HTYLQASEKFKMWG-NH2,杭州专肽生物的产品

HSV-1酶底物多肽:HSV-1-amide UL 26 Open Reading Frame (2

高度表征的单纯疱疹病毒 1 型蛋白酶 (HSV-1) 底物,它对病毒核衣壳形成和病毒复制至关重要。使用 HPLC 测量酶活性以将产物与底物分离并进行定量。用荧光检测器在 280 nm(激发)和 350 nm(发射)处检测 HTYLQASEKFKMWG-酰胺的 C 端切割产物。

编号:200167

CAS号:396716-24-8

单字母:H2N-HTYLQASEKFKMWG-NH2

纠错
  • 编号:200167
    中文名称:HSV-1酶底物多肽:HSV-1-amide UL 26 Open Reading Frame (2
    英文名:HSV-1-amide UL 26 Open Reading Frame (242-255)
    CAS号:396716-24-8
    单字母:H2N-HTYLQASEKFKMWG-NH2
    三字母:H2N

    N端氨基

    -His

    组氨酸

    -Thr

    苏氨酸

    -Tyr

    酪氨酸

    -Leu

    亮氨酸

    -Gln

    谷氨酰胺

    -Ala

    丙氨酸

    -Ser

    丝氨酸

    -Glu

    谷氨酸

    -Lys

    赖氨酸

    -Phe

    苯丙氨酸

    -Lys

    赖氨酸

    -Met

    甲硫氨酸

    -Trp

    色氨酸

    -Gly

    甘氨酸

    -NH2

    C端酰胺化

    氨基酸个数:14
    分子式:C80H117N21O20S1
    平均分子量:1724.98
    精确分子量:1723.85
    等电点(PI):10.92
    pH=7.0时的净电荷数:3.21
    平均亲水性:-0.33076923076923
    疏水性值:-0.81
    消光系数:6990
    来源:人工化学合成,仅限科学研究使用,不得用于人体。
    储存条件:负80℃至负20℃
    标签:酶底物肽(Substrate Peptide)    病毒学   

  • 高度表征的单纯疱疹病毒 1 型蛋白酶 (HSV-1) 底物,它对病毒核衣壳形成和病毒复制至关重要。使用 HPLC 测量酶活性以将产物与底物分离并进行定量。用荧光检测器在 280 nm(激发)和 350 nm(发射)处检测 HTYLQASEKFKMWG-酰胺的 C 端切割产物。

    Highly characterized substrate for herpes simplex virus type 1 protease (HSV-1), which is essential for viral nucleocapsid formation and for viral replication. Enzyme activity was measured using HPLC for the separation of the products from the substrate and for quantitation. The C-terminal cleavage product of HTYLQASEKFKMWG-amide was detected at 280 nm (excitation) and 350 nm (emission) with a fluorescence detector.

     Caspase酶对应的底物,Caspases(半胱氨酸天冬氨酸蛋白酶,半胱氨酸依赖性天冬氨酸定向蛋白酶)是一类蛋白酶家族,其功能与凋亡(程序性细胞死亡),坏死和发烧(炎症)的过程密切相关。

           什么是胱天蛋白酶?

          胱天蛋白酶(Caspases)是含半胱氨酸的天冬氨酸蛋白水解酶,它们是为细胞凋亡的主要介质。多种受体,例如TNF-α 受体,FasL受体,TLR和死亡受体,以及Bcl-2和凋亡抑制剂(IAP)蛋白家族参与并调节该caspase依赖性凋亡途径。一旦Caspase受到上游信号(外部或内在)刺激被激活,即会参与执行下游蛋白底物的水解作用,并触发一系列事件,导致细胞分解,死亡,吞噬作用和细胞碎片的清除。

          人Caspases酶

          人的Caspases家族基于序列相似性和生物学功能等共性主要可分为三大类:第一类由具有长胱天蛋白酶募集结构域的“炎症”胱天蛋白酶组成,他们对P4位上的较大的芳香族或疏水性残基具有亲和力。第二类由具有短的前体结构域的“细胞凋亡效应”胱天蛋白酶组成,而第三类由具有长的前提结构域的Pap位置具有亮氨酸或缬氨酸底物亲和力的“凋亡引发剂”胱天蛋白酶组成(表1)。

           表1. 人胱天蛋白酶的功能分类:

    细胞死亡途径 半胱天冬酶类型 酵素 物种
    细胞凋亡 启动器 Caspases 2 人与鼠
    细胞凋亡 启动器 Caspases 8 人与鼠
    细胞凋亡 启动器 Caspases 9 人与鼠
    细胞凋亡 启动器 Caspases 10 人的
    细胞凋亡 效应器 Caspases 3 人与鼠
    细胞凋亡 效应器 Caspases 6 人与鼠
    细胞凋亡 效应器 Caspases 6 人与鼠
    细胞焦亡 炎性的 Caspases 1 人与鼠
    细胞焦亡 炎性的 Caspases 4 人的
    细胞焦亡 炎性的 Caspases 5 人的

           启动器Caspase和效应器Caspase酶

          根据其在凋亡胱天蛋白酶途径中的作用,胱天蛋白酶可分为两类:启动器和效应器Caspase酶。启动器和效应器Caspas酶都具有由小亚基和大亚基组成的催化位点,Caspase酶的识别位

          凋亡启动器Caspase酶,例如caspase-2,-8,-9和-10可以启动caspase激活级联反应。Caspase-8对于形成死亡诱导信号复合物(DISC)是必不可少的,并且在激活后,Caspase-8激活下游效应子Caspase(例如Caspase 3)并介导线粒体中细胞色素c的释放。Caspase-8已被证明对IETD肽序列具有相对较高的底物选择性。凋亡效应胱天蛋白酶例如Caspase-3,-6和-7虽然不负责启动级联途径,但是当被激活时,它们在级联的中间和后续步骤中起着不可或缺的作用。Caspase-3(CPP32 / apopain)是关键效应器,因为它放大了来自启动器Caspase的信号,使用对Caspase-3有选择性的DEVD肽序列对活化的Caspase-3进行检测,可以检测Caspase-3的活性。

           Caspase酶底物和抑制剂

          Caspase底物和抑制剂由两个关键成分组成:Caspase识别序列和信号产生或蛋白酶抑制基序。不同Caspase识别序列不同,一般由三个或四个氨基酸组成(表2)。Caspase酶识别序列的N端通常有乙酰基(Ac)或碳苯甲氧基(Z)基团修饰,以增强膜的通透性。对应的Caspase识别特定的肽序列为其酶促反应切割位点,释放产生信号或抑制信号的基序。Caspase的显色和荧光底物均以相似的方式起作用,其中底物的信号或颜色强度与蛋白水解活性成正比。

           表2. Caspase的底物及其序列

    多肽 氨基酸序列 对应的Caspase的种类
    IETD Ile-Glu-Thr-Asp Caspase 8,颗粒酶B
    DEVD Asp-Glu-Val-Asp Caspase 3、6、7、8或10
    LEHD Leu-Glu-His-Asp Caspase 9
    VAD Val-Ala-Asp Caspase 1、2、3、6、8、9或10

             Caspase酶的显色底物

          Caspase的显色底物是有Caspase识别序列及生色基团组成,常见的生色团有pNA(对硝基苯胺或4-硝基苯胺),可使用酶标仪或分光光度计在405 nm处进行光密度检测。

           表3. Caspase的显色底物

    底物 Caspase 吸收(nm) 颜色
    Ac-DEVD-pNA * CAS 189950-66-1 * 半胱天冬酶3 405 nm 黄色
    Z-DEVD-pNA 半胱天冬酶3 405 nm 黄色
    Z-IETD-pNA * CAS 219138-21-3 * 半胱天冬酶8,颗粒酶B 405 nm 黄色

           Caspase的荧光底物

          Caspase的荧光底物的结构包含与半胱天冬酶识别相关的荧光团,例如7-氨基-4-甲基香豆素(AMC),7-氨基-4-三氟甲基香豆素(AFC), Rhodamine 110(R110)或ProRed™620。R110的Caspase底物比基于香豆素的Caspase底物(例如AMC和AFC)更敏感,但由于两步裂解过程,其动态范围更窄。 建议将R110标记的Caspase底物用于终点法测定,而将AMC和AFC标记的 Caspase底物用于动力学测定。

          图.从左到右,分别是AMC(7-氨基-4-甲基香豆素),AFC(7-氨基-4-三氟甲基香豆素),Rhodamine 110(R110)和ProRed™620的激发和发射光谱。

           表4.荧光半胱天冬酶底物。

    底物名称 对应的Caspase Ex(nm) Em(nm) ε¹ Φ²
    Ac-DEVD-AFC * CAS 201608-14-2 * 半胱天冬酶3、7 376 482 17000 0.53
    Ac-DEVD-AMC * CAS 169332-61-0 * 半胱天冬酶3、7 341 441 19000 N / D
    Z-DEVD-AFC 半胱天冬酶3、7 376 482 17000 0.53
    Z-DEVD-AMC * CAS 1135416-11-3 * 半胱天冬酶3、7 341 441 19000 N / D
    Z-DEVD-ProRed™620 半胱天冬酶3、7 532 619 N / D N / D
    (Z-DEVD)2 -R110 * CAS 223538-61-2 * 半胱天冬酶3、7 500 522 80000 N / D
    Z-DEVD-ProRed™620 半胱天冬酶3、7 532 619 N / D N / D
    Ac-IETD-AFC * CAS 211990-57-7 * 半胱天冬酶8,颗粒酶B 376 482 17000 0.53
    Z-IETD-AFC * CAS 219138-02-0 * 半胱天冬酶8,颗粒酶B 376 482 17000 0.53

           注意:

            1.ε=在其最大吸收波长处的摩尔消光系数(单位= cm -1-1)。

          2.Φ=水性缓冲液(pH 7.2)中的荧光量子产率。

           Caspase抑制剂

          Caspase抑制剂能与Caspase的活性位点结合并形成可逆或不可逆的连接,通常,Caspase抑制剂的结构由Caspase识别序列,诸如醛(-CHO)或氟甲基酮(-FMK)的官能团组成。具有醛官能团的胱天蛋白酶抑制剂是可逆的,而具有FMK的抑制剂是不可逆的。半胱天冬酶底物和抑制剂都具有较小的细胞毒性作用,因此,它们是研究半胱天冬酶活性的有用工具。

           表5. 可逆和不可逆的Caspase酶抑制剂

    抑制剂 Caspase的种类 是否可逆 Ex(nm) Em(nm)
    Ac-DEVD-CHO * CAS 169332-60-9 * 半胱天冬酶3、7 可逆的 -- --
    Ac-IETD-CHO * CAS 191338-86-0 * 半胱天冬酶8 可逆的 -- --
    mFluor™450-VAD-FMK 半胱天冬酶1,2,3,6,8,9,10 不可逆的 406 445
    mFluor™510-VAD-FMK 半胱天冬酶1,2,3,6,8,9,10 不可逆的 412 505
    FITC-C6-DEVD-FMK 半胱天冬酶3、7 不可逆的 491 516
    FITC-C6-DEVD-FMK 半胱天冬酶3、7 不可逆的 491 516
    FITC-C6-LEHD-FMK 半胱天冬酶9 不可逆的 491 516
    FITC-C6-LEHD-FMK 半胱天冬酶9 不可逆的 491 516
    FAM-VAD-FMK 半胱天冬酶1,2,3,6,8,9,10 不可逆的 493 517
    SRB-VAD-FMK [磺胺丁胺B-VAD-FMK] 半胱天冬酶1,2,3,6,8,9,10 不可逆的 559 577

  • DOI名称
    10.1074/jbc.270.39.22697Activation of the herpes simplex virus type 1 protease下载
  • 多肽H2N-His-Thr-Tyr-Leu-Gln-Ala-Ser-Glu-Lys-Phe-Lys-Met-Trp-Gly-NH2的合成步骤:

    1、合成MBHA树脂:取若干克的MBHA树脂(如初始取代度为0.5mmol/g)和1倍树脂摩尔量的Fmoc-Linker-OH加入到反应器中,加入DMF,搅拌使氨基酸完全溶解。再加入树脂2倍量的DIEPA,搅拌混合均匀。再加入树脂0.95倍量的HBTU,搅拌混合均匀。反应3-4小时后,用DMF洗涤3次。用2倍树脂体积的10%乙酸酐/DMF 进行封端30分钟。然后再用DMF洗涤3次,甲醇洗涤2次,DCM洗涤2次,再用甲醇洗涤2次。真空干燥12小时以上,得到干燥的树脂{Fmoc-Linker-MHBA Resin},测定取代度。这里测得取代度为 0.3mmol/g。结构如下图:

    2、脱Fmoc:取1.88g的上述树脂,用DCM或DMF溶胀20分钟。用DMF洗涤2遍。加3倍树脂体积的20%Pip/DMF溶液,鼓氮气30分钟,然后2倍树脂体积的DMF 洗涤5次。得到 H2N-Linker-MBHA Resin 。(此步骤脱除Fmoc基团,茚三酮检测为蓝色,Pip为哌啶)。结构图如下:

    3、缩合:取1.69mmol Fmoc-Gly-OH 氨基酸,加入到上述树脂里,加适当DMF溶解氨基酸,再依次加入3.38mmol DIPEA,1.61mmol HBTU。反应30分钟后,取小样洗涤,茚三酮检测为无色。用2倍树脂体积的DMF 洗涤3次树脂。(洗涤树脂,去掉残留溶剂,为下一步反应做准备)。得到Fmoc-Gly-Linker-MBHA Resin。氨基酸:DIPEA:HBTU:树脂=3:6:2.85:1(摩尔比)。结构图如下:

    4、依次循环步骤二、步骤三,依次得到

    H2N-Gly-Linker-MBHA Resin

    Fmoc-Trp(Boc)-Gly-Linker-MBHA Resin

    H2N-Trp(Boc)-Gly-Linker-MBHA Resin

    Fmoc-Met-Trp(Boc)-Gly-Linker-MBHA Resin

    H2N-Met-Trp(Boc)-Gly-Linker-MBHA Resin

    Fmoc-Lys(Boc)-Met-Trp(Boc)-Gly-Linker-MBHA Resin

    H2N-Lys(Boc)-Met-Trp(Boc)-Gly-Linker-MBHA Resin

    Fmoc-Phe-Lys(Boc)-Met-Trp(Boc)-Gly-Linker-MBHA Resin

    H2N-Phe-Lys(Boc)-Met-Trp(Boc)-Gly-Linker-MBHA Resin

    Fmoc-Lys(Boc)-Phe-Lys(Boc)-Met-Trp(Boc)-Gly-Linker-MBHA Resin

    H2N-Lys(Boc)-Phe-Lys(Boc)-Met-Trp(Boc)-Gly-Linker-MBHA Resin

    Fmoc-Glu(OtBu)-Lys(Boc)-Phe-Lys(Boc)-Met-Trp(Boc)-Gly-Linker-MBHA Resin

    H2N-Glu(OtBu)-Lys(Boc)-Phe-Lys(Boc)-Met-Trp(Boc)-Gly-Linker-MBHA Resin

    Fmoc-Ser(tBu)-Glu(OtBu)-Lys(Boc)-Phe-Lys(Boc)-Met-Trp(Boc)-Gly-Linker-MBHA Resin

    H2N-Ser(tBu)-Glu(OtBu)-Lys(Boc)-Phe-Lys(Boc)-Met-Trp(Boc)-Gly-Linker-MBHA Resin

    Fmoc-Ala-Ser(tBu)-Glu(OtBu)-Lys(Boc)-Phe-Lys(Boc)-Met-Trp(Boc)-Gly-Linker-MBHA Resin

    H2N-Ala-Ser(tBu)-Glu(OtBu)-Lys(Boc)-Phe-Lys(Boc)-Met-Trp(Boc)-Gly-Linker-MBHA Resin

    Fmoc-Gln(Trt)-Ala-Ser(tBu)-Glu(OtBu)-Lys(Boc)-Phe-Lys(Boc)-Met-Trp(Boc)-Gly-Linker-MBHA Resin

    H2N-Gln(Trt)-Ala-Ser(tBu)-Glu(OtBu)-Lys(Boc)-Phe-Lys(Boc)-Met-Trp(Boc)-Gly-Linker-MBHA Resin

    Fmoc-Leu-Gln(Trt)-Ala-Ser(tBu)-Glu(OtBu)-Lys(Boc)-Phe-Lys(Boc)-Met-Trp(Boc)-Gly-Linker-MBHA Resin

    H2N-Leu-Gln(Trt)-Ala-Ser(tBu)-Glu(OtBu)-Lys(Boc)-Phe-Lys(Boc)-Met-Trp(Boc)-Gly-Linker-MBHA Resin

    Fmoc-Tyr(tBu)-Leu-Gln(Trt)-Ala-Ser(tBu)-Glu(OtBu)-Lys(Boc)-Phe-Lys(Boc)-Met-Trp(Boc)-Gly-Linker-MBHA Resin

    H2N-Tyr(tBu)-Leu-Gln(Trt)-Ala-Ser(tBu)-Glu(OtBu)-Lys(Boc)-Phe-Lys(Boc)-Met-Trp(Boc)-Gly-Linker-MBHA Resin

    Fmoc-Thr(tBu)-Tyr(tBu)-Leu-Gln(Trt)-Ala-Ser(tBu)-Glu(OtBu)-Lys(Boc)-Phe-Lys(Boc)-Met-Trp(Boc)-Gly-Linker-MBHA Resin

    H2N-Thr(tBu)-Tyr(tBu)-Leu-Gln(Trt)-Ala-Ser(tBu)-Glu(OtBu)-Lys(Boc)-Phe-Lys(Boc)-Met-Trp(Boc)-Gly-Linker-MBHA Resin

    Fmoc-His(Trt)-Thr(tBu)-Tyr(tBu)-Leu-Gln(Trt)-Ala-Ser(tBu)-Glu(OtBu)-Lys(Boc)-Phe-Lys(Boc)-Met-Trp(Boc)-Gly-Linker-MBHA Resin

    以上中间结构,均可在专肽生物多肽计算器-多肽结构计算器中,一键画出。

    最后再经过步骤二得到 H2N-His(Trt)-Thr(tBu)-Tyr(tBu)-Leu-Gln(Trt)-Ala-Ser(tBu)-Glu(OtBu)-Lys(Boc)-Phe-Lys(Boc)-Met-Trp(Boc)-Gly-Linker-MBHA Resin,结构如下:

    5、切割:6倍树脂体积的切割液(或每1g树脂加8ml左右的切割液),摇床摇晃 2小时,过滤掉树脂,用冰无水乙醚沉淀滤液,并用冰无水乙醚洗涤沉淀物3次,最后将沉淀物放真空干燥釜中,常温干燥24小试,得到粗品H2N-His-Thr-Tyr-Leu-Gln-Ala-Ser-Glu-Lys-Phe-Lys-Met-Trp-Gly-NH2。结构图见产品结构图。

    切割液选择:1)TFA:H2O=95%:5%

    2)TFA:H2O:TIS=95%:2.5%:2.5%

    3)三氟乙酸:茴香硫醚:1,2-乙二硫醇:苯酚:水=87.5%:5%:2.5%:2.5%:2.5%

    (前两种适合没有容易氧化的氨基酸,例如Trp、Cys、Met。第三种适合几乎所有的序列。)

    6、纯化冻干:使用液相色谱纯化,收集目标峰液体,进行冻干,获得蓬松的粉末状固体多肽。不过这时要取小样复测下纯度 是否目标纯度。

    7、最后总结:

    杭州专肽生物技术有限公司(ALLPEPTIDE https://www.allpeptide.com)主营定制多肽合成业务,提供各类长肽,短肽,环肽,提供各类修饰肽,如:荧光标记修饰(CY3、CY5、CY5.5、CY7、FAM、FITC、Rhodamine B、TAMRA等),功能基团修饰肽(叠氮、炔基、DBCO、DOTA、NOTA等),同位素标记肽(N15、C13),订书肽(Stapled Peptide),脂肪酸修饰肽(Pal、Myr、Ste),磷酸化修饰肽(P-Ser、P-Thr、P-Tyr),环肽(酰胺键环肽、一对或者多对二硫键环),生物素标记肽,PEG修饰肽,甲基化修饰肽等。

    以上所有内容,为专肽生物原创内容,请勿发布到其他网站上。

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