高选择性 MMP-12 FRET 底物，kcat/Km 值为 1.85 · 10⁵ M⁻¹s⁻¹。除 MMP-13 (kcat/Km = 0.53 · 10 ⁵ M⁻¹s⁻¹) 和 MMP-9 (0.33 · 10⁵ M⁻¹s⁻¹) 外，其他 MMP 的底物较差。
编号：200243
CAS号：891198-38-2
单字母：Mca-PLGLEEA-Dap(Dnp)-CONH2
| 编号: | 200243 |
| 中文名称: | 基质金属蛋白酶MMP-12 FRET substrate |
| CAS号: | 891198-38-2 |
| 单字母: | Mca-PLGLEEA-Dap(Dnp)-CONH2 |
| 三字母: | MCA Mca、7-甲氧基香豆素-4-乙酸修饰 -ProL-脯氨酸：proline。系统命名为吡咯烷-(2S)-羧酸。为亚氨基酸。是编码氨基酸。在肽链中有特殊作用，如易形成顺式的肽键等。符号：P，Pro。 -LeuL-亮氨酸：leucine。系统命名为(2S)-氨基-4-甲基戊酸。是编码氨基酸。是哺乳动物的必需氨基酸。符号：L，Leu。 -Gly甘氨酸：glycine。系统命名为 2-氨基乙酸。是编码氨基酸中没有旋光性的最简单的氨基酸，因具有甜味而得名。符号：G，Gly。 -LeuL-亮氨酸：leucine。系统命名为(2S)-氨基-4-甲基戊酸。是编码氨基酸。是哺乳动物的必需氨基酸。符号：L，Leu。 -GluL-谷氨酸：glutamic acid。系统命名为(2S)-氨基-戊二酸。是编码氨基酸。符号：E，Glu。D-谷氨酸存在于多种细菌的细胞壁和某些细菌杆菌肽中。 -GluL-谷氨酸：glutamic acid。系统命名为(2S)-氨基-戊二酸。是编码氨基酸。符号：E，Glu。D-谷氨酸存在于多种细菌的细胞壁和某些细菌杆菌肽中。 -Ala丙氨酸：alanine。L-丙氨酸的系统命名为(2S)-氨基丙酸，是编码氨基酸，也叫L-α-丙氨酸。符号：A，Ala。D-丙氨酸存在于多种细菌细胞壁的糖肽中。β-丙氨酸是维生素泛酸和辅酶A的组分。 -Dap(Dnp)侧链Dnp保护的Dap -CONH2C端酰胺化 |
| 氨基酸个数: | 8 |
| 分子式: | C53H70O20N12 |
| 平均分子量: | 1195.19 |
| 精确分子量: | 1194.48 |
| 等电点(PI): | - |
| pH=7.0时的净电荷数: | -2 |
| 平均亲水性: | 0.38 |
| 疏水性值: | 0.06 |
| 消光系数: | - |
| 来源: | 人工化学合成，仅限科学研究使用，不得用于人体。 |
| 储存条件: | 负80℃至负20℃ |
| 标签: | 侧链保护基肽 |
Highly selective MMP-12 FRET substrate with a kcat/Km value of 1.85 · 10⁵ M⁻¹s⁻¹. Poor substrate of other MMPs with the exception of MMP-13 (kcat/Km = 0.53 · 10 ⁵ M⁻¹s⁻¹) and MMP-9 (0.33 · 10⁵ M⁻¹s⁻¹).
| DOI | 名称 | |
|---|---|---|
| 10.1074/jbc.M600222200 | Development of selective inhibitors and substrate of matrix metalloproteinase-12 | 下载 |
多肽MCA-Pro-Leu-Gly-Leu-Glu-Glu-Ala-Dap(Dnp)-NH2的合成步骤：
1、合成MBHA树脂：取若干克MBHA树脂（如初始取代度为0.5mmol/g）和1倍树脂摩尔量的Fmoc-Linker-OH加入到反应器中，加入DMF，搅拌使氨基酸完全溶解。再加入树脂2倍量的DIEPA，搅拌混合均匀。再加入树脂0.95倍量的HBTU，搅拌混合均匀。反应3-4小时后，用DMF洗涤3次。用2倍树脂体积的10%乙酸酐/DMF 进行封端30分钟。然后再用DMF洗涤3次，甲醇洗涤2次，DCM洗涤2次，再用甲醇洗涤2次。真空干燥12小时以上，得到干燥的树脂{Fmoc-Linker-MHBA Resin}，测定取代度。这里测得取代度为 0.3mmol/g。结构如下图：
2、脱Fmoc：取1.64g的上述树脂，用DCM或DMF溶胀20分钟。用DMF洗涤2遍。加3倍树脂体积的20%Pip/DMF溶液，鼓氮气30分钟，然后2倍树脂体积的DMF 洗涤5次。得到 H2N-Linker-MBHA Resin 。（此步骤脱除Fmoc基团，茚三酮检测为蓝色，Pip为哌啶）。结构图如下：
3、缩合：取1.48mmol Fmoc-Dap(Dnp)-OH 氨基酸，加入到上述树脂里，加适当DMF溶解氨基酸，再依次加入2.95mmol DIPEA，1.4mmol HBTU。反应30分钟后，取小样洗涤，茚三酮检测为无色。用2倍树脂体积的DMF 洗涤3次树脂。（洗涤树脂，去掉残留溶剂，为下一步反应做准备）。得到Fmoc-Dap(Dnp)-Linker-MBHA Resin。氨基酸：DIPEA：HBTU：树脂=3：6：2.85：1（摩尔比）。结构图如下：
4、依次循环步骤二、步骤三，依次得到
H2N-Dap(Dnp)-Linker-MBHA Resin
Fmoc-Ala-Dap(Dnp)-Linker-MBHA Resin
H2N-Ala-Dap(Dnp)-Linker-MBHA Resin
Fmoc-Glu(OtBu)-Ala-Dap(Dnp)-Linker-MBHA Resin
H2N-Glu(OtBu)-Ala-Dap(Dnp)-Linker-MBHA Resin
Fmoc-Glu(OtBu)-Glu(OtBu)-Ala-Dap(Dnp)-Linker-MBHA Resin
H2N-Glu(OtBu)-Glu(OtBu)-Ala-Dap(Dnp)-Linker-MBHA Resin
Fmoc-Leu-Glu(OtBu)-Glu(OtBu)-Ala-Dap(Dnp)-Linker-MBHA Resin
H2N-Leu-Glu(OtBu)-Glu(OtBu)-Ala-Dap(Dnp)-Linker-MBHA Resin
Fmoc-Gly-Leu-Glu(OtBu)-Glu(OtBu)-Ala-Dap(Dnp)-Linker-MBHA Resin
H2N-Gly-Leu-Glu(OtBu)-Glu(OtBu)-Ala-Dap(Dnp)-Linker-MBHA Resin
Fmoc-Leu-Gly-Leu-Glu(OtBu)-Glu(OtBu)-Ala-Dap(Dnp)-Linker-MBHA Resin
H2N-Leu-Gly-Leu-Glu(OtBu)-Glu(OtBu)-Ala-Dap(Dnp)-Linker-MBHA Resin
Fmoc-Pro-Leu-Gly-Leu-Glu(OtBu)-Glu(OtBu)-Ala-Dap(Dnp)-Linker-MBHA Resin
以上中间结构，均可在专肽生物多肽计算器-多肽结构计算器中，一键画出。
最后再经过步骤二得到 H2N-Pro-Leu-Gly-Leu-Glu(OtBu)-Glu(OtBu)-Ala-Dap(Dnp)-Linker-MBHA Resin，结构如下：
5、7-甲氧基香豆素-4-乙酸(MCA)反应连接：在上述树脂中，加入适当DMF后，再加入1.48mmol 7-甲氧基香豆素-4-乙酸(MCA)到树脂中，再加入2.95mmol DIPEA、1.4mmol HBTU，鼓氮气反应30分钟。用2倍树脂体积的DMF 洗涤3次树脂（洗涤树脂，去掉残留溶剂，为下一步反应做准备）。 得到MCA-Pro-Leu-Gly-Leu-Glu(OtBu)-Glu(OtBu)-Ala-Dap(Dnp)-Linker-MBHAResin。 结构如下：
5、切割：6倍树脂体积的切割液（或每1g树脂加8ml左右的切割液），摇床摇晃 2小时，过滤掉树脂，用冰无水乙醚沉淀滤液，并用冰无水乙醚洗涤沉淀物3次，最后将沉淀物放真空干燥釜中，常温干燥24小试，得到粗品MCA-Pro-Leu-Gly-Leu-Glu-Glu-Ala-Dap(Dnp)-NH2。结构图见产品结构图。
切割液选择：1）TFA：H2O=95%：5%
2）TFA：H2O：TIS=95%：2.5%：2.5%
3）三氟乙酸：茴香硫醚：1，2-乙二硫醇：苯酚：水=87.5%：5%：2.5%：2.5%：2.5%
（前两种适合没有容易氧化的氨基酸，例如Trp、Cys、Met。第三种适合几乎所有的序列。）
6、纯化冻干：使用液相色谱纯化，收集目标峰液体，进行冻干，获得蓬松的粉末状固体多肽。不过这时要取小样复测下纯度 是否目标纯度。
7、最后总结：
杭州专肽生物技术有限公司（ALLPEPTIDE https://www.allpeptide.com）主营定制多肽合成业务，提供各类长肽，短肽，环肽，提供各类修饰肽，如：荧光标记修饰（CY3、CY5、CY5.5、CY7、FAM、FITC、Rhodamine B、TAMRA等），功能基团修饰肽（叠氮、炔基、DBCO、DOTA、NOTA等），同位素标记肽（N15、C13），订书肽（Stapled Peptide）,脂肪酸修饰肽（Pal、Myr、Ste），磷酸化修饰肽（P-Ser、P-Thr、P-Tyr），环肽（酰胺键环肽、一对或者多对二硫键环），生物素标记肽，PEG修饰肽，甲基化修饰肽
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