如何正确书写多肽

通常多肽的书写有两种形式,单字母形式和三字母形式,不管是哪一种形式,所表达的多肽结构都是唯一的,这样避免出现分歧。另外国际上统一规定:多肽的N端(氮端)在最左边,多肽的C端(碳端)在最右边。


一、多肽的单字母书写形式 

什么叫单字母?

顾名思义就是一个字母代表一个氨基酸,通常用大写字母表示,如A代表丙氨酸、C代表半胱氨酸。如果是小写的话,代表对应氨基酸是D型的,如小写字母a代表D型丙氨酸、小写字母c代表D型半胱氨酸。

多肽单字母书写举例

1,多肽1序列: AGYFKVCM,共8个氨基酸,所有字母均是大写,说明所有的氨基酸均是天然存在的L型氨基酸。

2,多肽2序列:AGYFkvcm,共8个氨基酸,右边(C端)的四个氨基酸是小写,说明对应的四种氨基酸是和L型对称的D型氨基酸。

3,多肽1序列AGYFKVCM 也可以写成H-AGYFKVCM-OH,左边的H- 代表N端的氨基,可以写出来,也可以省略。右边的-OH 代表C端的羧基,同样可以写出来,也可以省略。不过通常为了美观整齐,H-和-OH同时写或同时不写。

4,多肽3序列:AGYFKVCM-NH2,与多肽1的区别是,右边多了-NH2,代表着C端酰胺化。


二、多肽的三字母书写形式

什么叫三字母?

顾名思义就是三个字母代表一个氨基酸,并且三字母和前面提到的单字母是一一对应关系。三个字母中,第一个字母大写,第二和第三个字母小写,如Ala 也是代表丙氨酸、Cys代表半胱氨酸。

多肽三字母书写举例

1,多肽1序列对应的三字母书写为:H-Ala-Gly-Tyr-Phe-Lys-Val-Cys-Met-OH,左侧“H”可以写为“H2N”,右侧“OH”可以写为“COOH”。

2,多肽3序列对应的三字母书写为:H-Ala-Gly-Tyr-Phe-Lys-Val-Cys-Met-NH2,C端酰胺化,左侧“H”可以写为“H2N”,右侧“NH2”可以写为“CONH2”。


三、特殊氨基酸书写,下面介绍几个常见的书写。

1,N端封端的书写,通常是乙酰封端,写法为Ac-Ala-Gly-Tyr-Phe-Lys-Val-Cys-Met-OH.

2, 磷酸化氨基酸的书写,H-Ala-Gly-pTyr-Phe-Lys-Val-Cys-Met-OH,AG-pY-FKVCM、H-Ala-Gly-Tyr(PO3H2)-Phe-Lys-Val-Cys-Met-OH,数字3和2 可以下标。

3,D型氨基酸的书写,单字母通常用小写表述,如多肽1中F变成对应的D型,

4,举例:

单字母:AGYfKVCM

三字母:H-Ala-Gly-Tyr-D-Phe-Lys-Val-Cys-Met-OH

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