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N端Boc保护；叔丁氧羰基或叔丁氧羰基（Boc）是胺的保护基团。Boc基团可用强酸去除，如用三氟乙酸在二氯甲烷中去除，或用HCl在甲醇中去除。

侧链tBu保护的丝氨酸，叔丁基醚保护基团在Fmoc-SPPS中常用于保护丝氨酸、苏氨酸、酪氨酸和羟脯氨酸的含羟基侧链，并可用强酸如三氟乙酸（TFA）去除。

L-组氨酸：histidine。系统命名为(2S)-氨基-3-(4-咪唑基)丙酸。其侧链带有弱碱性的咪唑基，为编码氨基酸。是幼小哺乳动物的必需氨基酸。符号：H，His。

侧链OtBu保护的天冬氨酸

C端甲酯化修饰，甲酯是最简单的酯类，在溶液合成中作为重要的半永久性C端保护基团。它们可以转化为肽肼，而肽肼是反应性肽叠氮化物的先驱体。叠氮偶联仍是肽溶液合成中片段偶联最常用的方法。