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1010104-65-0,DABCYL修饰肽:DABCYL-RRIN-OH; DABCYL-Arg-Arg-Ile-Asn-O,DABCYL-Arg-Arg-Ile-Asn-COOH,Dabcyl-RRIN-OH,杭州专肽生物的产品

DABCYL修饰肽:DABCYL-RRIN-OH; DABCYL-Arg-Arg-Ile-Asn-O

编号:192838

CAS号:1010104-65-0

单字母:Dabcyl-RRIN-OH

纠错
  • 编号:192838
    中文名称:DABCYL修饰肽:DABCYL-RRIN-OH; DABCYL-Arg-Arg-Ile-Asn-O
    英文名:DABCYL-RRIN-OH; DABCYL-Arg-Arg-Ile-Asn-OH
    CAS号:1010104-65-0
    单字母:Dabcyl-RRIN-OH
    三字母:DABCYL

    N端Dabcyl标记,4-(4-二甲氨基苯基偶氮)苯甲酰基(Dabcyl)是一种发色团,常与荧光团(如EDANS)结合用作猝灭剂。Dabcyl/EDANS FRET(荧光共振能量转移)对的福斯特半径为3.3纳米。

    -Arg

    L-精氨酸:arginine。系统命名为(2S)-氨基-5-胍基戊酸。在生理条件下带正电荷,为编码氨基酸。是幼小哺乳动物的必需氨基酸。符号:R,Arg。

    -Arg

    L-精氨酸:arginine。系统命名为(2S)-氨基-5-胍基戊酸。在生理条件下带正电荷,为编码氨基酸。是幼小哺乳动物的必需氨基酸。符号:R,Arg。

    -Ile

    L-异亮氨酸:isoleucine。系统命名为(2S)-氨基-(3R)-甲基戊酸。是编码氨基酸。有两个手性碳原子,是哺乳动物的必需氨基酸。符号:I,Ile。

    -Asn

    天冬酰胺:asparagine。L-天冬酰胺的系统命名为(2S)-氨基-3-氨酰基丙酸,是编码氨基酸。符号:N,Asn。D-天冬酰胺存在于短杆菌肽A分子中。

    -OH

    C端羧基:C-terminal carboxyl group。在肽或多肽链中含有游离羧基的氨基酸一端。在表示氨基酸序列时,通常将C端放在肽链的右边。

    氨基酸个数:4
    分子式:C37H56N14O7
    平均分子量:808.93
    精确分子量:808.45
    等电点(PI):-
    pH=7.0时的净电荷数:2
    平均亲水性:1.1
    疏水性值:-2
    消光系数:-
    来源:人工化学合成,仅限科学研究使用,不得用于人体。
    盐体系:可选TFA、HAc、HCl或其它
    储存条件:负80℃至负20℃
    标签:DABCYL标记肽   

  • DABCYL标记说明

    4-(4-二甲氨基苯基偶氮)苯甲酰基(Dabcyl)是一种发色团,常与荧光团(如EDANS)结合用作猝灭剂。Dabcyl/EDANS FRET(荧光共振能量转移)对的福斯特半径为3.3纳米。

    4-(4-Dimethylaminophenylazo)benzoyl (Dabcyl) is a chromophor often used as a quencher in conjunction with a fluorophore (e.g., EDANS). Dabcyl/EDANS FRET pair have a Forster radius of 3.3 nm.

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    Glossary: EDANS
    5-[(2-Aminoethyl)amino]naphthalene-1-sulfonyl (EDANS) is fluorophor with an excitation at 340 nm  and emission of 490 nm . EDANS is often paired together with acceptors like dabcyl for FRET experiements.
    Properties of Hemoglobin Decolorized with a Histidine-Specific Protease.
    Shi, Jing, et al. Journal of Food Science 80.6 (2015): E1202-E1208.

  • 多肽DABCYL-Arg-Arg-Ile-Asn-COOH的合成步骤:

    1、合成CTC树脂:称取2.92g CTC Resin(如初始取代度约为1.06mmol/g)和3.71mmol Fmoc-Asn(Trt)-OH于反应器中,加入适量DCM溶解氨基酸(需要注意,此时CTC树脂体积会增大好几倍,避免DCM溶液过少),再加入9.29mmol DIPEA(Mw:129.1,d:0.740g/ml),反应2-3小时后,可不抽滤溶液,直接加入1ml的HPLC级甲醇,封端半小时。依次用DMF洗涤2次,甲醇洗涤1次,DCM洗涤一次,甲醇洗涤一次,DCM洗涤一次,DMF洗涤2次(这里使用甲醇和DCM交替洗涤,是为了更好地去除其他溶质,有利于后续反应)。得到  Fmoc-Asn(Trt)-CTC Resin。结构图如下:

    2、脱Fmoc:加3倍树脂体积的20%Pip/DMF溶液,鼓氮气30分钟,然后2倍树脂体积的DMF 洗涤5次。得到 H2N-Asn(Trt)-CTC Resin 。(此步骤脱除Fmoc基团,茚三酮检测为蓝色,Pip为哌啶)。结构图如下:

    3、缩合:取9.29mmol Fmoc-Ile-OH 氨基酸,加入到上述树脂里,加适当DMF溶解氨基酸,再依次加入18.57mmol DIPEA,8.82mmol HBTU。反应30分钟后,取小样洗涤,茚三酮检测为无色。用2倍树脂体积的DMF 洗涤3次树脂。(洗涤树脂,去掉残留溶剂,为下一步反应做准备)。得到Fmoc-Ile-Asn(Trt)-CTC Resin。氨基酸:DIPEA:HBTU:树脂=3:6:2.85:1(摩尔比)。结构图如下:

    4、依次循环步骤二、步骤三,依次得到

    H2N-Ile-Asn(Trt)-CTC Resin

    Fmoc-Arg(Pbf)-Ile-Asn(Trt)-CTC Resin

    H2N-Arg(Pbf)-Ile-Asn(Trt)-CTC Resin

    Fmoc-Arg(Pbf)-Arg(Pbf)-Ile-Asn(Trt)-CTC Resin

    以上中间结构,均可在专肽生物多肽计算器-多肽结构计算器中,一键画出。

    最后再经过步骤二得到 H2N-Arg(Pbf)-Arg(Pbf)-Ile-Asn(Trt)-CTC Resin,结构如下:

    5、4-二甲胺偶氮苯-4’-羧酸(DABCYL)反应连接:在上述树脂中,加入适当DMF后,再加入9.29mmol 4-二甲胺偶氮苯-4’-羧酸(DABCYL)到树脂中,再加入18.57mmol DIPEA、8.82mmol HBTU,鼓氮气反应30分钟。用2倍树脂体积的DMF 洗涤3次树脂(洗涤树脂,去掉残留溶剂,为下一步反应做准备)。 得到DABCYL-Arg(Pbf)-Arg(Pbf)-Ile-Asn(Trt)-CTCResin。 结构如下:

    6、切割:6倍树脂体积的切割液(或每1g树脂加8ml左右的切割液),摇床摇晃 2小时,过滤掉树脂,用冰无水乙醚沉淀滤液,并用冰无水乙醚洗涤沉淀物3次,最后将沉淀物放真空干燥釜中,常温干燥24小试,得到粗品DABCYL-Arg-Arg-Ile-Asn-COOH。结构图见产品结构图。

    切割液选择:1)TFA:H2O=95%:5%

    2)TFA:H2O:TIS=95%:2.5%:2.5%

    3)三氟乙酸:茴香硫醚:1,2-乙二硫醇:苯酚:水=87.5%:5%:2.5%:2.5%:2.5%

    (前两种适合没有容易氧化的氨基酸,例如Trp、Cys、Met。第三种适合几乎所有的序列。)

    6、纯化冻干:使用液相色谱纯化,收集目标峰液体,进行冻干,获得蓬松的粉末状固体多肽。不过这时要取小样复测下纯度 是否目标纯度。

    7、最后总结:

    杭州专肽生物技术有限公司(ALLPEPTIDE https://www.allpeptide.com)主营定制多肽合成业务,提供各类长肽,短肽,环肽,提供各类修饰肽,如:荧光标记修饰(CY3、CY5、CY5.5、CY7、FAM、FITC、Rhodamine B、TAMRA等),功能基团修饰肽(叠氮、炔基、DBCO、DOTA、NOTA等),同位素标记肽(N15、C13),订书肽(Stapled Peptide),脂肪酸修饰肽(Pal、Myr、Ste),磷酸化修饰肽(P-Ser、P-Thr、P-Tyr),环肽(酰胺键环肽、一对或者多对二硫键环),生物素标记肽,PEG修饰肽,甲基化修饰肽

    以上所有内容,为专肽生物原创内容,请勿发布到其他网站上。

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