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多肽产品

149997-91-1,八肽SSIEFARL,H2N-Ser-Ser-Ile-Glu-Phe-Ala-Arg-Leu-COOH,H2N-SSIEFARL-OH,杭州专肽生物的产品

糖蛋白B(485-492)、Glycoprotein B (485-492)

来源于单纯疱疹病毒 (HSV) 糖蛋白 B 的免疫显性表位,对应其 498-505 残基序列,可作为 H-2Kb 限制性和 HSV-1/2 交叉反应性细胞毒性 T 淋巴细胞 (CTL) 识别表位。

编号:200622

CAS号:149997-91-1

单字母:H2N-SSIEFARL-OH

纠错
  • 编号:200622
    中文名称:糖蛋白B(485-492)、Glycoprotein B (485-492)
    英文名:Glycoprotein B (485-492)
    CAS号:149997-91-1
    单字母:H2N-SSIEFARL-OH
    三字母:H2N

    N端氨基

    -Ser

    丝氨酸

    -Ser

    丝氨酸

    -Ile

    异亮氨酸

    -Glu

    谷氨酸

    -Phe

    苯丙氨酸

    -Ala

    丙氨酸

    -Arg

    精氨酸

    -Leu

    亮氨酸

    -OH

    C端羧基

    氨基酸个数:8
    分子式:C41H67N11O13
    平均分子量:922.04
    精确分子量:921.49
    等电点(PI):10.56
    pH=7.0时的净电荷数:0.98
    平均亲水性:-2.7755575615629E-17
    疏水性值:0.41
    消光系数:-
    来源:人工化学合成,仅限科学研究使用,不得用于人体。
    储存条件:负80℃至负20℃
    标签:病毒学   

  • HSV-gB2 (498-505) 是来源于单纯疱疹病毒 (HSV) 糖蛋白 B 的免疫显性表位,对应其 498-505 残基序列,可作为 H-2Kb 限制性和 HSV-1/2 交叉反应性细胞毒性 T 淋巴细胞 (CTL) 识别表位。
    HSV-gB2 (498-505) is an immunodominant epitope from herpes simplex virus (HSV) glycoprotein B residues 498-505, acts as H-2Kb-restricted and HSV-1/2-cross-reactive cytotoxic T-lymphocyte (CTL) recognition epitope.

    背景
    糖蛋白B(485-492)的化学式为C41H67N11O13,氨基酸序列为H2N-Ser-Ser-Ile-Glu-Phe-Ala-Arg-Leu-OH,分子量为922.04。糖蛋白B是一种病毒糖蛋白,参与单纯疱疹病毒(HSV)进入细胞的过程。疱疹病毒含有一个包被和一个外脂质双层,其中包含12个表面糖蛋白。单纯疱疹病毒包被与细胞膜融合,经过内吞作用,双链DNA基因组进入宿主细胞,产生感染(1)。疱疹病毒糖蛋白B是所有细胞膜糖蛋白中最高度保守的,主要作为融合蛋白。gB和gH/ gL的精确功能未知,但它们对于病毒进入细胞是必须的,构成核心融合单位。糖蛋白B的胞质域内的某些突变引起显著的合胞体表型(2),且与其它病毒融合蛋白具有结构同源性,由此认为gB参与了融合过程(3)。

    参考文献:

    1. PereiraL, Ali M, Kousoulas K, Huo B, Banks T (September 1989). "Domain structure of herpes simplex virus 1 glycoprotein B: neutralizing epitopes map in regions of continuous and discontinuous residues". Virology 172 (1): 11–24.

    2. Bender FC, Samanta M, Heldwein EE, de Leon MP, Bilman E, Lou H, Whitbeck JC, Eisenberg RJ, Cohen GH (April 2007). "Antigenic and mutational analyses of herpes simplex virus glycoprotein B reveal four functional regions". J. Virol. 81 (8): 3827–41.

    3. Heldwein EE, Lou H, Bender FC, Cohen GH, Eisenberg RJ, Harrison SC (July 2006). "Crystalstructure of glycoprotein B from herpes simplex virus 1". Science 313 (5784): 217–20.

     

  • DOI名称
    10.1006/viro.1993.1346Epitope specificity of H-2Kb-restricted, HSV-1-, and HSV-2-cross-reactive cytotoxic T lymphocyte clones下载
  • 多肽H2N-Ser-Ser-Ile-Glu-Phe-Ala-Arg-Leu-COOH的合成步骤:

    1、合成CTC树脂:称取2.96g CTC Resin(如初始取代度约为1.14mmol/g)和4.05mmol Fmoc-Leu-OH于反应器中,加入适量DCM溶解氨基酸(需要注意,此时CTC树脂体积会增大好几倍,避免DCM溶液过少),再加入10.12mmol DIPEA(Mw:129.1,d:0.740g/ml),反应2-3小时后,可不抽滤溶液,直接加入1ml的HPLC级甲醇,封端半小时。依次用DMF洗涤2次,甲醇洗涤1次,DCM洗涤一次,甲醇洗涤一次,DCM洗涤一次,DMF洗涤2次(这里使用甲醇和DCM交替洗涤,是为了更好地去除其他溶质,有利于后续反应)。得到  Fmoc-Leu-CTC Resin。结构图如下:

    2、脱Fmoc:加3倍树脂体积的20%Pip/DMF溶液,鼓氮气30分钟,然后2倍树脂体积的DMF 洗涤5次。得到 H2N-Leu-CTC Resin 。(此步骤脱除Fmoc基团,茚三酮检测为蓝色,Pip为哌啶)。结构图如下:

    3、缩合:取10.12mmol Fmoc-Arg(Pbf)-OH 氨基酸,加入到上述树脂里,加适当DMF溶解氨基酸,再依次加入20.25mmol DIPEA,9.62mmol HBTU。反应30分钟后,取小样洗涤,茚三酮检测为无色。用2倍树脂体积的DMF 洗涤3次树脂。(洗涤树脂,去掉残留溶剂,为下一步反应做准备)。得到Fmoc-Arg(Pbf)-Leu-CTC Resin。氨基酸:DIPEA:HBTU:树脂=3:6:2.85:1(摩尔比)。结构图如下:

    4、依次循环步骤二、步骤三,依次得到

    H2N-Arg(Pbf)-Leu-CTC Resin

    Fmoc-Ala-Arg(Pbf)-Leu-CTC Resin

    H2N-Ala-Arg(Pbf)-Leu-CTC Resin

    Fmoc-Phe-Ala-Arg(Pbf)-Leu-CTC Resin

    H2N-Phe-Ala-Arg(Pbf)-Leu-CTC Resin

    Fmoc-Glu(OtBu)-Phe-Ala-Arg(Pbf)-Leu-CTC Resin

    H2N-Glu(OtBu)-Phe-Ala-Arg(Pbf)-Leu-CTC Resin

    Fmoc-Ile-Glu(OtBu)-Phe-Ala-Arg(Pbf)-Leu-CTC Resin

    H2N-Ile-Glu(OtBu)-Phe-Ala-Arg(Pbf)-Leu-CTC Resin

    Fmoc-Ser(tBu)-Ile-Glu(OtBu)-Phe-Ala-Arg(Pbf)-Leu-CTC Resin

    H2N-Ser(tBu)-Ile-Glu(OtBu)-Phe-Ala-Arg(Pbf)-Leu-CTC Resin

    Fmoc-Ser(tBu)-Ser(tBu)-Ile-Glu(OtBu)-Phe-Ala-Arg(Pbf)-Leu-CTC Resin

    以上中间结构,均可在专肽生物多肽计算器-多肽结构计算器中,一键画出。

    最后再经过步骤二得到 H2N-Ser(tBu)-Ser(tBu)-Ile-Glu(OtBu)-Phe-Ala-Arg(Pbf)-Leu-CTC Resin,结构如下:

    5、切割:6倍树脂体积的切割液(或每1g树脂加8ml左右的切割液),摇床摇晃 2小时,过滤掉树脂,用冰无水乙醚沉淀滤液,并用冰无水乙醚洗涤沉淀物3次,最后将沉淀物放真空干燥釜中,常温干燥24小试,得到粗品H2N-Ser-Ser-Ile-Glu-Phe-Ala-Arg-Leu-COOH。结构图见产品结构图。

    切割液选择:1)TFA:H2O=95%:5%、TFA:H2O=97.5%:2.5%

    2)TFA:H2O:TIS=95%:2.5%:2.5%

    3)三氟乙酸:茴香硫醚:1,2-乙二硫醇:苯酚:水=87.5%:5%:2.5%:2.5%:2.5%

    (前两种适合没有容易氧化的氨基酸,例如Trp、Cys、Met。第三种适合几乎所有的序列。)

    6、纯化冻干:使用液相色谱纯化,收集目标峰液体,进行冻干,获得蓬松的粉末状固体多肽。不过这时要取小样复测下纯度 是否目标纯度。

    7、最后总结:

    杭州专肽生物技术有限公司(ALLPEPTIDE https://www.allpeptide.com)主营定制多肽合成业务,提供各类长肽,短肽,环肽,提供各类修饰肽,如:荧光标记修饰(CY3、CY5、CY5.5、CY7、FAM、FITC、Rhodamine B、TAMRA等),功能基团修饰肽(叠氮、炔基、DBCO、DOTA、NOTA等),同位素标记肽(N15、C13),订书肽(Stapled Peptide),脂肪酸修饰肽(Pal、Myr、Ste),磷酸化修饰肽(P-Ser、P-Thr、P-Tyr),环肽(酰胺键环肽、一对或者多对二硫键环),生物素标记肽,PEG修饰肽,甲基化修饰肽

    以上所有内容,为专肽生物原创内容,请勿发布到其他网站上。

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