多肽荧光标记由于没有放射性，实验操作简单。因此，目前在生物学研究中多肽荧光标记应用非常广泛，多肽荧光标记方法与荧光试剂的结构有关系，对于有游离羧基的采用的方法与接多肽反应相同，也采用HBTU/HOBt/DIEA方法连接。 在N端标记FITC的多肽需经历环化作用来形成荧光素，通常会伴有最后一个氨基酸的去除，但当有一个间隔器如氨基己酸，或者是通过非酸性环境将目的多肽从树脂上切下来时，这种情况可避免在切割的过程中被TFA切割掉。
（红色加粗的荧光基团，为常用基团)
| 荧光标记分类 | 标记基团 | 入射波长 | 发射波长 | 标记位置 | 结构 |
|
Alexa Fluor系列
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Alexa Fluor 350
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346
|
445 |
肽链 N 端、Lys 侧链和 Cys 侧链
|
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|
Alexa Fluor 405
|
400
|
424
|
肽链 N 端、Lys 侧链和 Cys 侧链
|
||
|
Alexa Fluor 430
|
430
|
545
|
肽链 N 端、Lys 侧链和 Cys 侧链
|
||
|
Alexa Fluor 488
|
494
|
517
|
肽链 N 端、Lys 侧链和 Cys 侧链
|
||
|
Alexa Fluor 514
|
517
|
542
|
肽链 N 端、Lys 侧链和 Cys 侧链
|
||
|
Alexa Fluor 532
|
530
|
555
|
肽链 N 端、Lys 侧链和 Cys 侧链
|
||
|
Alexa Fluor 594
|
590
|
617
|
肽链 N 端、Lys 侧链和 Cys 侧链
|
||
| Alexa Fluor 647 | 650 | 668 | 肽链 N 端、Lys 侧链和 Cys 侧链 | ||
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Bodipy系列
|
Bodipy 493/503
|
500 | 506 | 肽链 N 端、Lys 侧链和 Cys 侧链 | |
|
Bodipy FL
|
503 | 509 | 肽链 N 端、Lys 侧链和 Cys 侧链 | ||
|
Bodipy R6G
|
528 | 550 | 肽链 N 端、Lys 侧链和 Cys 侧链 | ||
|
Bodipy 530/550
|
534 | 554 | 肽链 N 端、Lys 侧链 | ||
|
Bodipy TMR-X
|
542 | 574 | 肽链 N 端、Lys 侧链和 Cys 侧链 | ||
|
Bodipy 558/568
|
558 | 569 | 肽链 N 端、Lys 侧链和 Cys 侧链 | ||
|
Bodipy 576/589
|
576 | 590 | 肽链 N 端、Lys 侧链和 Cys 侧链 | ||
|
Bodipy 581/591
|
584 | 592 | 肽链 N 端、Lys 侧链 | ||
|
Bodipy TR
|
589 | 617 | 肽链 N 端、Lys 侧链和 Cys 侧链 | ||
|
Bodipy 630/650
|
625 | 640 | 肽链 N 端、Lys 侧链 | ||
|
Cy系列荧
|
Cy-3 | 550 | 570 | 肽链 N 端、Lys 侧链和 Cys 侧链 | |
| Cy-5 | 646 | 662 | 肽链 N 端、Lys 侧链和 Cys 侧链 | ||
| Cy-5.5 | 673 | 707 | 肽链 N 端、Lys 侧链和 Cys 侧链 | ||
| Cy-7 | 750 | 773 | 肽链 N 端、Lys 侧链和 Cys 侧链 | ||
|
Fluorescein系列荧
|
FITC | 492 | 518 | 肽链 N 端、Lys 侧链和 Cys 侧链 | |
| FAM | 494 | 522 | 肽链 N 端、Lys 侧链和 Cys 侧链 | ||
|
QSY系列
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QSY-7
|
560 | None | 肽链 N 端、Lys 侧链和 Cys 侧链 | |
|
QSY-9
|
562 | None | 肽链 N 端、Lys 侧链和 Cys 侧链 | ||
|
QSY-21
|
661 | None | 肽链 N 端、Lys 侧链和 Cys 侧链 | ||
|
Rhodamine系列
|
Texas Red
|
595 | 615 | 肽链 N 端、Lys 侧链和 Cys 侧链 | |
|
RF488
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498 | 520 | 肽链 N 端、Lys 侧链和 Cys 侧链 | ||
|
TAMRA
|
565 | 580 | 肽链 N 端、Lys 侧链和 Cys 侧链 | ||
|
Rhodamine B
|
555 | 580 | 肽链 N 端、Lys 侧链 | ||
|
Rhodamine Red-X
|
570 | 590 | 肽链 N 端、Lys 侧链 | ||
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其它荧光标记
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Dansyl
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333 | 518 | 肽链 N 端、Lys 侧链 | |
|
Dabcyl
|
454
|
None | 肽链 N 端、Lys 侧链 | ||
|
DNP
|
350 | None | 肽链 N 端、Lys 侧链 | ||
|
MCA
|
358 | 410 | 肽链 N 端、Lys 侧链 | ||
|
SBF
|
385 and 515
|
None | Cys 侧链 | ||
|
EDANS
|
335 | 493 |
Glu 或 Asp 侧链
|
||
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7-OHCCA
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342(pH=4)
|
447(pH=4)
|
肽链 N 端和 Lys 侧链
|
||
|
Dacia
|
376 | 465 | Cys 侧链 | ||
| BHQ-1 | 480 | 580 | 肽链 N 端、Lys 侧链 | ||
| BHQ-2 | 560 | 670 | 肽链 N 端、Lys 侧链 | ||
| BHQ-3 | 620 | 730 | 肽链 N 端、Lys 侧链 | ||
| JOE | 520 | 548 | 肽链 N 端、Lys 侧链 |
1、产品序列：BHQ-1-Arg-Lys-Cys-Pro-Leu-Met-Trp-Ser-Gly-Gly-OH
2、产品结构：
3、产品HPLC报告：
4、产品紫外检测报告：
