衍生自 p75 神经营养蛋白受体 (p75NTR) 的一种肽,对应于人类受体的残基 368-381。在胶束脂质存在下,NTR 368 具有螺旋形成倾向。
编号:197273
CAS号:197230-90-3
单字母:Ac-ATLDALLAALRRIQ-NH2
编号: | 197273 |
中文名称: | 十四肽Ac-ATLDALLAALRRIQ-NH2 |
CAS号: | 197230-90-3 |
单字母: | Ac-ATLDALLAALRRIQ-NH2 |
三字母: | Ac N端乙酰化封端 -Ala丙氨酸 -Thr苏氨酸 -Leu亮氨酸 -Asp天冬氨酸 -Ala丙氨酸 -Leu亮氨酸 -Leu亮氨酸 -Ala丙氨酸 -Ala丙氨酸 -Leu亮氨酸 -Arg精氨酸 -Arg精氨酸 -Ile异亮氨酸 -Gln谷氨酰胺 -NH2C端酰胺化 |
氨基酸个数: | 14 |
分子式: | C69H124O19N22 |
平均分子量: | 1565.86 |
精确分子量: | 1564.94 |
等电点(PI): | 12.51 |
pH=7.0时的净电荷数: | 1 |
平均亲水性: | -0.15714285714286 |
疏水性值: | 0.73 |
外观与性状: | 白色粉末状固体 |
消光系数: | - |
来源: | 人工化学合成,仅限科学研究使用,不得用于人体。 |
纯度: | 95%、98% |
盐体系: | 可选TFA、HAc、HCl或其它 |
储存条件: | 负80℃至负20℃ |
标签: | 未分类肽 |
NTR 368 是衍生自 p75 神经营养蛋白受体 (p75NTR) 的一种肽,对应于人类受体的残基 368-381。在胶束脂质存在下,NTR 368 具有螺旋形成倾向。NTR 368 是神经细胞凋亡 (apoptosis) 的有效诱导剂。
NTR 368 is a peptide derived from p75 neurotrophin receptor (p75NTR) corresponding to residues 368-381 of the human receptor. NTR 368 has helix forming propensity in the presence of micellar lipid. NTR 368 is a potent inducer of neural apoptosis[1].
M R Hileman, et al. A cytoplasmic peptide of the neurotrophin receptor p75NTR: induction of apoptosis and NMR determined helical conformation. FEBS Lett. 1997 Sep 29;415(2):145-54. : https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/9350985
多肽Ac-Ala-Thr-Leu-Asp-Ala-Leu-Leu-Ala-Ala-Leu-Arg-Arg-Ile-Gln-NH2的合成步骤:
1、合成MBHA树脂:取若干克MBHA树脂(如初始取代度为0.5mmol/g)和1倍树脂摩尔量的Fmoc-Linker-OH加入到反应器中,加入DMF,搅拌使氨基酸完全溶解。再加入树脂2倍量的DIEPA,搅拌混合均匀。再加入树脂0.95倍量的HBTU,搅拌混合均匀。反应3-4小时后,用DMF洗涤3次。用2倍树脂体积的10%乙酸酐/DMF 进行封端30分钟。然后再用DMF洗涤3次,甲醇洗涤2次,DCM洗涤2次,再用甲醇洗涤2次。真空干燥12小时以上,得到干燥的树脂{Fmoc-Linker-MHBA Resin},测定取代度。这里测得取代度为 0.3mmol/g。结构如下图:
2、脱Fmoc:取2.26g的上述树脂,用DCM或DMF溶胀20分钟。用DMF洗涤2遍。加3倍树脂体积的20%Pip/DMF溶液,鼓氮气30分钟,然后2倍树脂体积的DMF 洗涤5次。得到 H2N-Linker-MBHA Resin 。(此步骤脱除Fmoc基团,茚三酮检测为蓝色,Pip为哌啶)。结构图如下:
3、缩合:取2.03mmol Fmoc-Gln(Trt)-OH 氨基酸,加入到上述树脂里,加适当DMF溶解氨基酸,再依次加入4.07mmol DIPEA,1.93mmol HBTU。反应30分钟后,取小样洗涤,茚三酮检测为无色。用2倍树脂体积的DMF 洗涤3次树脂。(洗涤树脂,去掉残留溶剂,为下一步反应做准备)。得到Fmoc-Gln(Trt)-Linker-MBHA Resin。氨基酸:DIPEA:HBTU:树脂=3:6:2.85:1(摩尔比)。结构图如下:
4、依次循环步骤二、步骤三,依次得到
H2N-Gln(Trt)-Linker-MBHA Resin
Fmoc-Ile-Gln(Trt)-Linker-MBHA Resin
H2N-Ile-Gln(Trt)-Linker-MBHA Resin
Fmoc-Arg(Pbf)-Ile-Gln(Trt)-Linker-MBHA Resin
H2N-Arg(Pbf)-Ile-Gln(Trt)-Linker-MBHA Resin
Fmoc-Arg(Pbf)-Arg(Pbf)-Ile-Gln(Trt)-Linker-MBHA Resin
H2N-Arg(Pbf)-Arg(Pbf)-Ile-Gln(Trt)-Linker-MBHA Resin
Fmoc-Leu-Arg(Pbf)-Arg(Pbf)-Ile-Gln(Trt)-Linker-MBHA Resin
H2N-Leu-Arg(Pbf)-Arg(Pbf)-Ile-Gln(Trt)-Linker-MBHA Resin
Fmoc-Ala-Leu-Arg(Pbf)-Arg(Pbf)-Ile-Gln(Trt)-Linker-MBHA Resin
H2N-Ala-Leu-Arg(Pbf)-Arg(Pbf)-Ile-Gln(Trt)-Linker-MBHA Resin
Fmoc-Ala-Ala-Leu-Arg(Pbf)-Arg(Pbf)-Ile-Gln(Trt)-Linker-MBHA Resin
H2N-Ala-Ala-Leu-Arg(Pbf)-Arg(Pbf)-Ile-Gln(Trt)-Linker-MBHA Resin
Fmoc-Leu-Ala-Ala-Leu-Arg(Pbf)-Arg(Pbf)-Ile-Gln(Trt)-Linker-MBHA Resin
H2N-Leu-Ala-Ala-Leu-Arg(Pbf)-Arg(Pbf)-Ile-Gln(Trt)-Linker-MBHA Resin
Fmoc-Leu-Leu-Ala-Ala-Leu-Arg(Pbf)-Arg(Pbf)-Ile-Gln(Trt)-Linker-MBHA Resin
H2N-Leu-Leu-Ala-Ala-Leu-Arg(Pbf)-Arg(Pbf)-Ile-Gln(Trt)-Linker-MBHA Resin
Fmoc-Ala-Leu-Leu-Ala-Ala-Leu-Arg(Pbf)-Arg(Pbf)-Ile-Gln(Trt)-Linker-MBHA Resin
H2N-Ala-Leu-Leu-Ala-Ala-Leu-Arg(Pbf)-Arg(Pbf)-Ile-Gln(Trt)-Linker-MBHA Resin
Fmoc-Asp(OtBu)-Ala-Leu-Leu-Ala-Ala-Leu-Arg(Pbf)-Arg(Pbf)-Ile-Gln(Trt)-Linker-MBHA Resin
H2N-Asp(OtBu)-Ala-Leu-Leu-Ala-Ala-Leu-Arg(Pbf)-Arg(Pbf)-Ile-Gln(Trt)-Linker-MBHA Resin
Fmoc-Leu-Asp(OtBu)-Ala-Leu-Leu-Ala-Ala-Leu-Arg(Pbf)-Arg(Pbf)-Ile-Gln(Trt)-Linker-MBHA Resin
H2N-Leu-Asp(OtBu)-Ala-Leu-Leu-Ala-Ala-Leu-Arg(Pbf)-Arg(Pbf)-Ile-Gln(Trt)-Linker-MBHA Resin
Fmoc-Thr(tBu)-Leu-Asp(OtBu)-Ala-Leu-Leu-Ala-Ala-Leu-Arg(Pbf)-Arg(Pbf)-Ile-Gln(Trt)-Linker-MBHA Resin
H2N-Thr(tBu)-Leu-Asp(OtBu)-Ala-Leu-Leu-Ala-Ala-Leu-Arg(Pbf)-Arg(Pbf)-Ile-Gln(Trt)-Linker-MBHA Resin
Fmoc-Ala-Thr(tBu)-Leu-Asp(OtBu)-Ala-Leu-Leu-Ala-Ala-Leu-Arg(Pbf)-Arg(Pbf)-Ile-Gln(Trt)-Linker-MBHA Resin
以上中间结构,均可在专肽生物多肽计算器-多肽结构计算器中,一键画出。
最后再经过步骤二得到 H2N-Ala-Thr(tBu)-Leu-Asp(OtBu)-Ala-Leu-Leu-Ala-Ala-Leu-Arg(Pbf)-Arg(Pbf)-Ile-Gln(Trt)-Linker-MBHA Resin,结构如下:
5、乙酸酐反应连接:在上述树脂中,加入适当DMF后,再加入2.03mmol乙酸酐到树脂中,再加入4.07mmol DIPEA,鼓氮气反应30分钟。用2倍树脂体积的DMF 洗涤3次树脂(洗涤树脂,去掉残留溶剂,为下一步反应做准备)。 得到Ac-Ala-Thr(tBu)-Leu-Asp(OtBu)-Ala-Leu-Leu-Ala-Ala-Leu-Arg(Pbf)-Arg(Pbf)-Ile-Gln(Trt)-Linker-MBHAResin。 结构如下:
6、切割:6倍树脂体积的切割液(或每1g树脂加8ml左右的切割液),摇床摇晃 2小时,过滤掉树脂,用冰无水乙醚沉淀滤液,并用冰无水乙醚洗涤沉淀物3次,最后将沉淀物放真空干燥釜中,常温干燥24小试,得到粗品Ac-Ala-Thr-Leu-Asp-Ala-Leu-Leu-Ala-Ala-Leu-Arg-Arg-Ile-Gln-NH2。结构图见产品结构图。
切割液选择:1)TFA:H2O=95%:5%
2)TFA:H2O:TIS=95%:2.5%:2.5%
3)三氟乙酸:茴香硫醚:1,2-乙二硫醇:苯酚:水=87.5%:5%:2.5%:2.5%:2.5%
(前两种适合没有容易氧化的氨基酸,例如Trp、Cys、Met。第三种适合几乎所有的序列。)
7、纯化冻干:使用液相色谱纯化,收集目标峰液体,进行冻干,获得蓬松的粉末状固体多肽。不过这时要取小样复测下纯度 是否目标纯度。
8、最后总结:
杭州专肽生物技术有限公司(ALLPEPTIDE https://www.allpeptide.com)主营定制多肽合成业务,提供各类长肽,短肽,环肽,提供各类修饰肽,如:荧光标记修饰(CY3、CY5、CY5.5、CY7、FAM、FITC、Rhodamine B、TAMRA等),功能基团修饰肽(叠氮、炔基、DBCO、DOTA、NOTA等),同位素标记肽(N15、C13),订书肽(Stapled Peptide),脂肪酸修饰肽(Pal、Myr、Ste),磷酸化修饰肽(P-Ser、P-Thr、P-Tyr),环肽(酰胺键环肽、一对或者多对二硫键环),生物素标记肽,PEG修饰肽,甲基化修饰肽等。
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